Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PTPRCP08575 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PTPRCP08575 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
PTPRCP08575 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PTPRCP08575 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
PTPRCP08575 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
PTPRCP08575 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
PTPRCP08575 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
PTPRCP08575 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PTPRCP08575 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PTPRCP08575 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRCP08575 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRCP08575 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRCP08575 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRCP08575 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRCP08575 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PTPRCP08575 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PTPRCP08575 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPRCP08575 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPRCP08575 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPRCP08575 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPRCP08575 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPRCP08575 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPRCP08575 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PTPRCP08575 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PTPRCP08575 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
PTPRCP08575 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PTPRCP08575 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PTPRCP08575 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PTPRCP08575 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTPRCP08575 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTPRCP08575 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTPRCP08575 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTPRCP08575 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PTPRCP08575 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
PTPRCP08575 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPRCP08575 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPRCP08575 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PTPRCP08575 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PTPRCP08575 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PTPRCP08575 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PTPRCP08575 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
PTPRCP08575 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PTPRCP08575 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PTPRCP08575 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PTPRCP08575 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRCP08575 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRCP08575 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRCP08575 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRCP08575 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRCP08575 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PTPRCP08575 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PTPRCP08575 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PTPRCP08575 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PTPRCP08575 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PTPRCP08575 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PTPRCP08575 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PTPRCP08575 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PTPRCP08575 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PTPRCP08575 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PTPRCP08575 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PTPRCP08575 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PTPRCP08575 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PTPRCP08575 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PTPRCP08575 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
PTPRCP08575 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PTPRCP08575 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PTPRCP08575 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PTPRCP08575 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PTPRCP08575 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PTPRCP08575 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRCP08575 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRCP08575 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRCP08575 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRCP08575 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRCP08575 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRCP08575 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PTPRCP08575 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PTPRCP08575 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PTPRCP08575 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTPRCP08575 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTPRCP08575 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTPRCP08575 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTPRCP08575 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTPRCP08575 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTPRCP08575 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
PTPRCP08575 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
PTPRCP08575 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTPRCP08575 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTPRCP08575 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTPRCP08575 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
PTPRCP08575 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTPRCP08575 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTPRCP08575 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTPRCP08575 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTPRCP08575 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRCP08575 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRCP08575 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRCP08575 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRCP08575 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
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