Protein–RNA interactions for Protein: P04628

WNT1, Proto-oncogene Wnt-1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WNT1P04628 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
WNT1P04628 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
WNT1P04628 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
WNT1P04628 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
WNT1P04628 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
WNT1P04628 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
WNT1P04628 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
WNT1P04628 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
WNT1P04628 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
WNT1P04628 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
WNT1P04628 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
WNT1P04628 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
WNT1P04628 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
WNT1P04628 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
WNT1P04628 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
WNT1P04628 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
WNT1P04628 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
WNT1P04628 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
WNT1P04628 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
WNT1P04628 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
WNT1P04628 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
WNT1P04628 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
WNT1P04628 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
WNT1P04628 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
WNT1P04628 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
WNT1P04628 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
WNT1P04628 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
WNT1P04628 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
WNT1P04628 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
WNT1P04628 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
WNT1P04628 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
WNT1P04628 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
WNT1P04628 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
WNT1P04628 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
WNT1P04628 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
WNT1P04628 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
WNT1P04628 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
WNT1P04628 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
WNT1P04628 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
WNT1P04628 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
WNT1P04628 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
WNT1P04628 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
WNT1P04628 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
WNT1P04628 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
WNT1P04628 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
WNT1P04628 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
WNT1P04628 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
WNT1P04628 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
WNT1P04628 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
WNT1P04628 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
WNT1P04628 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
WNT1P04628 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
WNT1P04628 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
WNT1P04628 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
WNT1P04628 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
WNT1P04628 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
WNT1P04628 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
WNT1P04628 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
WNT1P04628 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
WNT1P04628 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
WNT1P04628 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
WNT1P04628 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
WNT1P04628 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
WNT1P04628 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
WNT1P04628 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
WNT1P04628 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
WNT1P04628 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
WNT1P04628 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
WNT1P04628 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
WNT1P04628 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
WNT1P04628 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
WNT1P04628 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
WNT1P04628 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
WNT1P04628 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
WNT1P04628 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
WNT1P04628 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
WNT1P04628 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
WNT1P04628 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
WNT1P04628 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
WNT1P04628 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
WNT1P04628 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
WNT1P04628 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
WNT1P04628 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
WNT1P04628 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
WNT1P04628 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
WNT1P04628 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
WNT1P04628 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
WNT1P04628 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
WNT1P04628 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
WNT1P04628 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
WNT1P04628 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
WNT1P04628 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
WNT1P04628 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
WNT1P04628 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
WNT1P04628 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
WNT1P04628 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
WNT1P04628 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
WNT1P04628 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
WNT1P04628 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
WNT1P04628 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms