Protein–RNA interactions for Protein: P04433

IGKV3-11, Immunoglobulin kappa variable 3-11, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-11P04433 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGKV3-11P04433 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGKV3-11P04433 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGKV3-11P04433 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGKV3-11P04433 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGKV3-11P04433 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGKV3-11P04433 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGKV3-11P04433 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGKV3-11P04433 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGKV3-11P04433 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGKV3-11P04433 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGKV3-11P04433 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGKV3-11P04433 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGKV3-11P04433 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGKV3-11P04433 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGKV3-11P04433 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGKV3-11P04433 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGKV3-11P04433 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGKV3-11P04433 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGKV3-11P04433 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IGKV3-11P04433 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGKV3-11P04433 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGKV3-11P04433 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGKV3-11P04433 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGKV3-11P04433 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGKV3-11P04433 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGKV3-11P04433 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGKV3-11P04433 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGKV3-11P04433 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGKV3-11P04433 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGKV3-11P04433 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGKV3-11P04433 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGKV3-11P04433 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
IGKV3-11P04433 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGKV3-11P04433 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGKV3-11P04433 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGKV3-11P04433 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGKV3-11P04433 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGKV3-11P04433 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
IGKV3-11P04433 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGKV3-11P04433 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
IGKV3-11P04433 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGKV3-11P04433 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGKV3-11P04433 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGKV3-11P04433 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGKV3-11P04433 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGKV3-11P04433 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGKV3-11P04433 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGKV3-11P04433 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IGKV3-11P04433 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGKV3-11P04433 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGKV3-11P04433 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGKV3-11P04433 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGKV3-11P04433 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IGKV3-11P04433 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGKV3-11P04433 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGKV3-11P04433 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGKV3-11P04433 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGKV3-11P04433 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGKV3-11P04433 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGKV3-11P04433 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGKV3-11P04433 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGKV3-11P04433 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGKV3-11P04433 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
IGKV3-11P04433 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGKV3-11P04433 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGKV3-11P04433 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGKV3-11P04433 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGKV3-11P04433 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGKV3-11P04433 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGKV3-11P04433 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGKV3-11P04433 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IGKV3-11P04433 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IGKV3-11P04433 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IGKV3-11P04433 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IGKV3-11P04433 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IGKV3-11P04433 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IGKV3-11P04433 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGKV3-11P04433 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGKV3-11P04433 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGKV3-11P04433 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGKV3-11P04433 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGKV3-11P04433 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGKV3-11P04433 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
IGKV3-11P04433 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGKV3-11P04433 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGKV3-11P04433 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGKV3-11P04433 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGKV3-11P04433 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGKV3-11P04433 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGKV3-11P04433 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGKV3-11P04433 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGKV3-11P04433 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGKV3-11P04433 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGKV3-11P04433 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGKV3-11P04433 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGKV3-11P04433 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGKV3-11P04433 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGKV3-11P04433 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGKV3-11P04433 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms