Protein–RNA interactions for Protein: P02708

CHRNA1, Acetylcholine receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA1P02708 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHRNA1P02708 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHRNA1P02708 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHRNA1P02708 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHRNA1P02708 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
CHRNA1P02708 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHRNA1P02708 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHRNA1P02708 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CHRNA1P02708 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHRNA1P02708 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHRNA1P02708 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHRNA1P02708 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHRNA1P02708 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHRNA1P02708 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHRNA1P02708 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CHRNA1P02708 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHRNA1P02708 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHRNA1P02708 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHRNA1P02708 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHRNA1P02708 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHRNA1P02708 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHRNA1P02708 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHRNA1P02708 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CHRNA1P02708 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHRNA1P02708 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHRNA1P02708 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHRNA1P02708 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHRNA1P02708 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHRNA1P02708 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHRNA1P02708 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHRNA1P02708 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHRNA1P02708 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHRNA1P02708 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHRNA1P02708 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHRNA1P02708 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CHRNA1P02708 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHRNA1P02708 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHRNA1P02708 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHRNA1P02708 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHRNA1P02708 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHRNA1P02708 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHRNA1P02708 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHRNA1P02708 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHRNA1P02708 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHRNA1P02708 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CHRNA1P02708 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHRNA1P02708 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHRNA1P02708 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHRNA1P02708 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHRNA1P02708 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHRNA1P02708 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CHRNA1P02708 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHRNA1P02708 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHRNA1P02708 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHRNA1P02708 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHRNA1P02708 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHRNA1P02708 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CHRNA1P02708 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHRNA1P02708 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHRNA1P02708 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHRNA1P02708 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHRNA1P02708 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CHRNA1P02708 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHRNA1P02708 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHRNA1P02708 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHRNA1P02708 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHRNA1P02708 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHRNA1P02708 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CHRNA1P02708 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHRNA1P02708 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHRNA1P02708 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CHRNA1P02708 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHRNA1P02708 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHRNA1P02708 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHRNA1P02708 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHRNA1P02708 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CHRNA1P02708 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHRNA1P02708 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHRNA1P02708 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHRNA1P02708 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHRNA1P02708 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHRNA1P02708 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHRNA1P02708 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHRNA1P02708 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHRNA1P02708 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHRNA1P02708 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHRNA1P02708 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHRNA1P02708 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CHRNA1P02708 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHRNA1P02708 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CHRNA1P02708 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CHRNA1P02708 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHRNA1P02708 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHRNA1P02708 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHRNA1P02708 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHRNA1P02708 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CHRNA1P02708 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHRNA1P02708 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHRNA1P02708 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHRNA1P02708 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms