Protein–RNA interactions for Protein: P01817

IGHV2-5, Immunoglobulin heavy variable 2-5, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV2-5P01817 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGHV2-5P01817 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGHV2-5P01817 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGHV2-5P01817 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGHV2-5P01817 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IGHV2-5P01817 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGHV2-5P01817 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGHV2-5P01817 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGHV2-5P01817 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGHV2-5P01817 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
IGHV2-5P01817 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGHV2-5P01817 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGHV2-5P01817 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGHV2-5P01817 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGHV2-5P01817 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGHV2-5P01817 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGHV2-5P01817 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGHV2-5P01817 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHV2-5P01817 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHV2-5P01817 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHV2-5P01817 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHV2-5P01817 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHV2-5P01817 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHV2-5P01817 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHV2-5P01817 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHV2-5P01817 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHV2-5P01817 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHV2-5P01817 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHV2-5P01817 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHV2-5P01817 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHV2-5P01817 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHV2-5P01817 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHV2-5P01817 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHV2-5P01817 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHV2-5P01817 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHV2-5P01817 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHV2-5P01817 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHV2-5P01817 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHV2-5P01817 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHV2-5P01817 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHV2-5P01817 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHV2-5P01817 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHV2-5P01817 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGHV2-5P01817 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGHV2-5P01817 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGHV2-5P01817 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGHV2-5P01817 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IGHV2-5P01817 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IGHV2-5P01817 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
IGHV2-5P01817 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGHV2-5P01817 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGHV2-5P01817 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IGHV2-5P01817 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGHV2-5P01817 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IGHV2-5P01817 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGHV2-5P01817 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGHV2-5P01817 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGHV2-5P01817 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
IGHV2-5P01817 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.3■■□□□ 1
IGHV2-5P01817 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
IGHV2-5P01817 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IGHV2-5P01817 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGHV2-5P01817 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGHV2-5P01817 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IGHV2-5P01817 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGHV2-5P01817 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGHV2-5P01817 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IGHV2-5P01817 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IGHV2-5P01817 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGHV2-5P01817 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGHV2-5P01817 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGHV2-5P01817 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IGHV2-5P01817 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IGHV2-5P01817 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IGHV2-5P01817 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IGHV2-5P01817 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IGHV2-5P01817 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
IGHV2-5P01817 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IGHV2-5P01817 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
IGHV2-5P01817 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGHV2-5P01817 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGHV2-5P01817 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGHV2-5P01817 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGHV2-5P01817 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGHV2-5P01817 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGHV2-5P01817 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGHV2-5P01817 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGHV2-5P01817 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGHV2-5P01817 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGHV2-5P01817 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGHV2-5P01817 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGHV2-5P01817 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGHV2-5P01817 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGHV2-5P01817 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGHV2-5P01817 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGHV2-5P01817 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGHV2-5P01817 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGHV2-5P01817 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGHV2-5P01817 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGHV2-5P01817 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.7 ms