Protein–RNA interactions for Protein: O95810

CAVIN2, Caveolae-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN2O95810 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CAVIN2O95810 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CAVIN2O95810 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAVIN2O95810 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CAVIN2O95810 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAVIN2O95810 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CAVIN2O95810 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAVIN2O95810 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAVIN2O95810 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAVIN2O95810 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAVIN2O95810 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAVIN2O95810 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAVIN2O95810 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CAVIN2O95810 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CAVIN2O95810 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CAVIN2O95810 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CAVIN2O95810 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CAVIN2O95810 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CAVIN2O95810 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CAVIN2O95810 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CAVIN2O95810 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAVIN2O95810 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAVIN2O95810 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAVIN2O95810 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAVIN2O95810 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAVIN2O95810 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAVIN2O95810 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAVIN2O95810 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAVIN2O95810 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAVIN2O95810 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAVIN2O95810 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAVIN2O95810 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAVIN2O95810 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAVIN2O95810 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CAVIN2O95810 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CAVIN2O95810 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CAVIN2O95810 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CAVIN2O95810 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CAVIN2O95810 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CAVIN2O95810 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CAVIN2O95810 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CAVIN2O95810 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CAVIN2O95810 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CAVIN2O95810 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CAVIN2O95810 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAVIN2O95810 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CAVIN2O95810 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAVIN2O95810 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAVIN2O95810 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAVIN2O95810 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAVIN2O95810 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAVIN2O95810 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAVIN2O95810 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAVIN2O95810 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAVIN2O95810 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAVIN2O95810 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAVIN2O95810 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAVIN2O95810 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CAVIN2O95810 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CAVIN2O95810 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CAVIN2O95810 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CAVIN2O95810 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CAVIN2O95810 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CAVIN2O95810 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAVIN2O95810 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAVIN2O95810 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAVIN2O95810 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAVIN2O95810 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAVIN2O95810 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CAVIN2O95810 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAVIN2O95810 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CAVIN2O95810 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CAVIN2O95810 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CAVIN2O95810 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CAVIN2O95810 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAVIN2O95810 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAVIN2O95810 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAVIN2O95810 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAVIN2O95810 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CAVIN2O95810 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CAVIN2O95810 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAVIN2O95810 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAVIN2O95810 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAVIN2O95810 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CAVIN2O95810 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CAVIN2O95810 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CAVIN2O95810 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAVIN2O95810 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAVIN2O95810 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAVIN2O95810 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAVIN2O95810 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAVIN2O95810 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAVIN2O95810 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAVIN2O95810 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAVIN2O95810 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAVIN2O95810 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAVIN2O95810 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CAVIN2O95810 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAVIN2O95810 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAVIN2O95810 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms