Protein–RNA interactions for Protein: O94913

PCF11, Pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCF11O94913 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
PCF11O94913 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
PCF11O94913 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
PCF11O94913 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC40.37■■■■■ 4.05
PCF11O94913 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
PCF11O94913 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
PCF11O94913 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC40.34■■■■■ 4.05
PCF11O94913 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC40.33■■■■■ 4.05
PCF11O94913 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
PCF11O94913 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
PCF11O94913 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC40.32■■■■■ 4.05
PCF11O94913 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
PCF11O94913 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
PCF11O94913 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
PCF11O94913 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC40.29■■■■■ 4.04
PCF11O94913 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
PCF11O94913 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
PCF11O94913 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC40.28■■■■■ 4.04
PCF11O94913 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
PCF11O94913 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
PCF11O94913 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC40.26■■■■■ 4.04
PCF11O94913 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.03
PCF11O94913 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
PCF11O94913 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
PCF11O94913 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
PCF11O94913 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
PCF11O94913 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
PCF11O94913 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
PCF11O94913 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
PCF11O94913 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
PCF11O94913 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
PCF11O94913 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
PCF11O94913 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
PCF11O94913 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
PCF11O94913 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
PCF11O94913 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
PCF11O94913 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
PCF11O94913 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
PCF11O94913 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
PCF11O94913 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
PCF11O94913 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
PCF11O94913 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
PCF11O94913 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
PCF11O94913 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
PCF11O94913 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC40.17■■■■■ 4.02
PCF11O94913 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
PCF11O94913 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
PCF11O94913 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
PCF11O94913 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
PCF11O94913 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
PCF11O94913 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
PCF11O94913 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
PCF11O94913 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
PCF11O94913 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC40.14■■■■■ 4.02
PCF11O94913 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
PCF11O94913 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC40.14■■■■■ 4.02
PCF11O94913 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
PCF11O94913 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
PCF11O94913 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
PCF11O94913 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
PCF11O94913 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
PCF11O94913 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
PCF11O94913 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
PCF11O94913 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
PCF11O94913 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
PCF11O94913 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC40.11■■■■■ 4.01
PCF11O94913 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
PCF11O94913 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
PCF11O94913 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
PCF11O94913 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
PCF11O94913 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
PCF11O94913 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
PCF11O94913 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC40.09■■■■■ 4.01
PCF11O94913 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC40.09■■■■■ 4.01
PCF11O94913 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
PCF11O94913 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
PCF11O94913 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
PCF11O94913 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
PCF11O94913 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
PCF11O94913 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4
PCF11O94913 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC40.07■■■■■ 4
PCF11O94913 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
PCF11O94913 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
PCF11O94913 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC40.06■■■■■ 4
PCF11O94913 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
PCF11O94913 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
PCF11O94913 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC40.04■■■■■ 4
PCF11O94913 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC40.04■■■■■ 4
PCF11O94913 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
PCF11O94913 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
PCF11O94913 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC40.01■■■■■ 4
PCF11O94913 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
PCF11O94913 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
PCF11O94913 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
PCF11O94913 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
PCF11O94913 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC39.98■■■■□ 3.99
PCF11O94913 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
PCF11O94913 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
PCF11O94913 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
PCF11O94913 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms