Protein–RNA interactions for Protein: O75386

TULP3, Tubby-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP3O75386 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TULP3O75386 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TULP3O75386 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TULP3O75386 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TULP3O75386 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TULP3O75386 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TULP3O75386 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TULP3O75386 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TULP3O75386 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TULP3O75386 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TULP3O75386 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TULP3O75386 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TULP3O75386 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TULP3O75386 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TULP3O75386 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TULP3O75386 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TULP3O75386 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TULP3O75386 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TULP3O75386 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TULP3O75386 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TULP3O75386 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TULP3O75386 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TULP3O75386 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TULP3O75386 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TULP3O75386 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TULP3O75386 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TULP3O75386 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TULP3O75386 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TULP3O75386 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TULP3O75386 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TULP3O75386 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TULP3O75386 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TULP3O75386 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TULP3O75386 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TULP3O75386 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TULP3O75386 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TULP3O75386 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TULP3O75386 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TULP3O75386 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TULP3O75386 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TULP3O75386 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TULP3O75386 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TULP3O75386 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TULP3O75386 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TULP3O75386 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TULP3O75386 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TULP3O75386 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TULP3O75386 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TULP3O75386 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TULP3O75386 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TULP3O75386 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TULP3O75386 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TULP3O75386 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TULP3O75386 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TULP3O75386 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TULP3O75386 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TULP3O75386 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TULP3O75386 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TULP3O75386 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TULP3O75386 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TULP3O75386 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TULP3O75386 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TULP3O75386 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TULP3O75386 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TULP3O75386 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TULP3O75386 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TULP3O75386 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TULP3O75386 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TULP3O75386 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TULP3O75386 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TULP3O75386 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TULP3O75386 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TULP3O75386 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TULP3O75386 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TULP3O75386 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TULP3O75386 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TULP3O75386 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TULP3O75386 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TULP3O75386 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TULP3O75386 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TULP3O75386 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TULP3O75386 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TULP3O75386 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TULP3O75386 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TULP3O75386 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TULP3O75386 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TULP3O75386 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TULP3O75386 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TULP3O75386 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TULP3O75386 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TULP3O75386 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TULP3O75386 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TULP3O75386 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TULP3O75386 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TULP3O75386 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TULP3O75386 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TULP3O75386 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TULP3O75386 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TULP3O75386 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TULP3O75386 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms