Protein–RNA interactions for Protein: O75140

DEPDC5, GATOR complex protein DEPDC5, humanhuman

Predictions only

Length 1,603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC5O75140 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
DEPDC5O75140 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
DEPDC5O75140 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
DEPDC5O75140 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
DEPDC5O75140 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
DEPDC5O75140 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
DEPDC5O75140 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
DEPDC5O75140 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
DEPDC5O75140 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
DEPDC5O75140 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
DEPDC5O75140 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
DEPDC5O75140 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
DEPDC5O75140 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
DEPDC5O75140 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
DEPDC5O75140 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
DEPDC5O75140 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
DEPDC5O75140 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
DEPDC5O75140 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
DEPDC5O75140 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
DEPDC5O75140 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
DEPDC5O75140 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
DEPDC5O75140 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
DEPDC5O75140 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
DEPDC5O75140 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
DEPDC5O75140 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
DEPDC5O75140 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
DEPDC5O75140 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
DEPDC5O75140 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
DEPDC5O75140 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
DEPDC5O75140 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
DEPDC5O75140 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
DEPDC5O75140 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
DEPDC5O75140 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
DEPDC5O75140 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
DEPDC5O75140 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
DEPDC5O75140 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
DEPDC5O75140 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
DEPDC5O75140 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
DEPDC5O75140 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
DEPDC5O75140 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
DEPDC5O75140 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
DEPDC5O75140 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
DEPDC5O75140 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
DEPDC5O75140 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
DEPDC5O75140 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
DEPDC5O75140 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
DEPDC5O75140 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
DEPDC5O75140 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
DEPDC5O75140 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
DEPDC5O75140 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
DEPDC5O75140 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
DEPDC5O75140 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
DEPDC5O75140 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC37.81■■■■□ 3.64
DEPDC5O75140 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
DEPDC5O75140 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
DEPDC5O75140 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
DEPDC5O75140 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
DEPDC5O75140 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
DEPDC5O75140 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
DEPDC5O75140 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC37.79■■■■□ 3.64
DEPDC5O75140 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
DEPDC5O75140 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
DEPDC5O75140 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
DEPDC5O75140 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
DEPDC5O75140 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC37.76■■■■□ 3.63
DEPDC5O75140 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
DEPDC5O75140 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
DEPDC5O75140 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
DEPDC5O75140 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
DEPDC5O75140 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
DEPDC5O75140 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
DEPDC5O75140 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
DEPDC5O75140 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
DEPDC5O75140 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
DEPDC5O75140 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
DEPDC5O75140 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
DEPDC5O75140 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
DEPDC5O75140 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
DEPDC5O75140 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
DEPDC5O75140 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC37.65■■■■□ 3.62
DEPDC5O75140 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
DEPDC5O75140 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
DEPDC5O75140 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
DEPDC5O75140 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
DEPDC5O75140 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
DEPDC5O75140 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
DEPDC5O75140 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
DEPDC5O75140 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
DEPDC5O75140 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
DEPDC5O75140 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
DEPDC5O75140 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
DEPDC5O75140 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
DEPDC5O75140 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
DEPDC5O75140 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
DEPDC5O75140 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
DEPDC5O75140 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
DEPDC5O75140 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
DEPDC5O75140 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
DEPDC5O75140 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
DEPDC5O75140 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms