Protein–RNA interactions for Protein: O60869

EDF1, Endothelial differentiation-related factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDF1O60869 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDF1O60869 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDF1O60869 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDF1O60869 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDF1O60869 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDF1O60869 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EDF1O60869 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EDF1O60869 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EDF1O60869 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EDF1O60869 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EDF1O60869 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EDF1O60869 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
EDF1O60869 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EDF1O60869 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EDF1O60869 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EDF1O60869 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EDF1O60869 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EDF1O60869 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EDF1O60869 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EDF1O60869 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EDF1O60869 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
EDF1O60869 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EDF1O60869 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EDF1O60869 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EDF1O60869 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
EDF1O60869 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25■■□□□ 1.59
EDF1O60869 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EDF1O60869 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EDF1O60869 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EDF1O60869 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EDF1O60869 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EDF1O60869 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EDF1O60869 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EDF1O60869 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EDF1O60869 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EDF1O60869 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EDF1O60869 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EDF1O60869 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDF1O60869 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDF1O60869 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDF1O60869 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EDF1O60869 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EDF1O60869 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EDF1O60869 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EDF1O60869 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDF1O60869 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDF1O60869 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDF1O60869 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDF1O60869 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDF1O60869 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDF1O60869 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDF1O60869 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDF1O60869 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDF1O60869 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDF1O60869 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDF1O60869 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDF1O60869 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDF1O60869 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDF1O60869 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDF1O60869 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDF1O60869 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDF1O60869 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDF1O60869 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EDF1O60869 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EDF1O60869 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDF1O60869 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDF1O60869 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDF1O60869 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDF1O60869 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDF1O60869 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDF1O60869 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDF1O60869 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDF1O60869 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDF1O60869 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDF1O60869 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDF1O60869 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDF1O60869 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDF1O60869 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDF1O60869 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDF1O60869 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDF1O60869 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDF1O60869 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDF1O60869 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDF1O60869 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDF1O60869 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDF1O60869 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDF1O60869 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDF1O60869 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EDF1O60869 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EDF1O60869 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EDF1O60869 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EDF1O60869 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
EDF1O60869 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
EDF1O60869 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
EDF1O60869 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
EDF1O60869 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
EDF1O60869 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDF1O60869 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDF1O60869 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDF1O60869 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms