Protein–RNA interactions for Protein: O60683

PEX10, Peroxisome biogenesis factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX10O60683 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PEX10O60683 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PEX10O60683 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PEX10O60683 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PEX10O60683 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PEX10O60683 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PEX10O60683 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PEX10O60683 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PEX10O60683 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PEX10O60683 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PEX10O60683 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PEX10O60683 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PEX10O60683 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PEX10O60683 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PEX10O60683 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PEX10O60683 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PEX10O60683 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PEX10O60683 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PEX10O60683 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PEX10O60683 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PEX10O60683 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PEX10O60683 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PEX10O60683 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PEX10O60683 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PEX10O60683 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PEX10O60683 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PEX10O60683 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PEX10O60683 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PEX10O60683 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PEX10O60683 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PEX10O60683 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PEX10O60683 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PEX10O60683 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PEX10O60683 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PEX10O60683 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PEX10O60683 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PEX10O60683 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PEX10O60683 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PEX10O60683 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PEX10O60683 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PEX10O60683 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PEX10O60683 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PEX10O60683 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PEX10O60683 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PEX10O60683 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PEX10O60683 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PEX10O60683 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PEX10O60683 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PEX10O60683 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PEX10O60683 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PEX10O60683 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PEX10O60683 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PEX10O60683 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PEX10O60683 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PEX10O60683 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PEX10O60683 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PEX10O60683 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PEX10O60683 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PEX10O60683 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PEX10O60683 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PEX10O60683 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PEX10O60683 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PEX10O60683 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PEX10O60683 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PEX10O60683 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PEX10O60683 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PEX10O60683 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PEX10O60683 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PEX10O60683 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PEX10O60683 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PEX10O60683 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PEX10O60683 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PEX10O60683 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PEX10O60683 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PEX10O60683 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PEX10O60683 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PEX10O60683 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PEX10O60683 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PEX10O60683 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PEX10O60683 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PEX10O60683 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PEX10O60683 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PEX10O60683 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PEX10O60683 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PEX10O60683 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PEX10O60683 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PEX10O60683 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PEX10O60683 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PEX10O60683 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PEX10O60683 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PEX10O60683 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PEX10O60683 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PEX10O60683 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PEX10O60683 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PEX10O60683 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PEX10O60683 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PEX10O60683 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PEX10O60683 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PEX10O60683 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PEX10O60683 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166 ms