Protein–RNA interactions for Protein: O60678

PRMT3, Protein arginine N-methyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRMT3O60678 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PRMT3O60678 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRMT3O60678 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRMT3O60678 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRMT3O60678 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRMT3O60678 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRMT3O60678 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRMT3O60678 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRMT3O60678 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRMT3O60678 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRMT3O60678 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRMT3O60678 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRMT3O60678 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRMT3O60678 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRMT3O60678 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRMT3O60678 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRMT3O60678 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRMT3O60678 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRMT3O60678 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PRMT3O60678 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRMT3O60678 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRMT3O60678 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRMT3O60678 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRMT3O60678 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRMT3O60678 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRMT3O60678 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRMT3O60678 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRMT3O60678 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRMT3O60678 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRMT3O60678 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRMT3O60678 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRMT3O60678 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRMT3O60678 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRMT3O60678 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRMT3O60678 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRMT3O60678 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRMT3O60678 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PRMT3O60678 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRMT3O60678 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRMT3O60678 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRMT3O60678 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRMT3O60678 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
PRMT3O60678 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRMT3O60678 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PRMT3O60678 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRMT3O60678 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRMT3O60678 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRMT3O60678 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRMT3O60678 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRMT3O60678 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PRMT3O60678 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRMT3O60678 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRMT3O60678 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRMT3O60678 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PRMT3O60678 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRMT3O60678 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRMT3O60678 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRMT3O60678 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRMT3O60678 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PRMT3O60678 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRMT3O60678 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRMT3O60678 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRMT3O60678 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRMT3O60678 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRMT3O60678 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRMT3O60678 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRMT3O60678 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRMT3O60678 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRMT3O60678 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRMT3O60678 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRMT3O60678 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRMT3O60678 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRMT3O60678 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRMT3O60678 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRMT3O60678 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRMT3O60678 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRMT3O60678 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRMT3O60678 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRMT3O60678 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PRMT3O60678 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PRMT3O60678 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PRMT3O60678 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRMT3O60678 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRMT3O60678 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRMT3O60678 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRMT3O60678 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRMT3O60678 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRMT3O60678 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRMT3O60678 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRMT3O60678 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRMT3O60678 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRMT3O60678 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRMT3O60678 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRMT3O60678 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRMT3O60678 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRMT3O60678 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRMT3O60678 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRMT3O60678 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRMT3O60678 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRMT3O60678 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms