Protein–RNA interactions for Protein: O60522

TDRD6, Tudor domain-containing protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD6O60522 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TDRD6O60522 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TDRD6O60522 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TDRD6O60522 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TDRD6O60522 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TDRD6O60522 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TDRD6O60522 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TDRD6O60522 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TDRD6O60522 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TDRD6O60522 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TDRD6O60522 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TDRD6O60522 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TDRD6O60522 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TDRD6O60522 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TDRD6O60522 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TDRD6O60522 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TDRD6O60522 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TDRD6O60522 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TDRD6O60522 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TDRD6O60522 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TDRD6O60522 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TDRD6O60522 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TDRD6O60522 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TDRD6O60522 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TDRD6O60522 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TDRD6O60522 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TDRD6O60522 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TDRD6O60522 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TDRD6O60522 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TDRD6O60522 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TDRD6O60522 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TDRD6O60522 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TDRD6O60522 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TDRD6O60522 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TDRD6O60522 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TDRD6O60522 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TDRD6O60522 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TDRD6O60522 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TDRD6O60522 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TDRD6O60522 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TDRD6O60522 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TDRD6O60522 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TDRD6O60522 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TDRD6O60522 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TDRD6O60522 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TDRD6O60522 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TDRD6O60522 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TDRD6O60522 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TDRD6O60522 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TDRD6O60522 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
TDRD6O60522 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TDRD6O60522 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TDRD6O60522 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TDRD6O60522 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TDRD6O60522 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TDRD6O60522 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TDRD6O60522 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TDRD6O60522 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TDRD6O60522 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TDRD6O60522 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TDRD6O60522 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TDRD6O60522 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TDRD6O60522 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TDRD6O60522 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TDRD6O60522 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TDRD6O60522 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TDRD6O60522 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TDRD6O60522 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TDRD6O60522 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TDRD6O60522 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TDRD6O60522 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TDRD6O60522 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TDRD6O60522 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TDRD6O60522 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TDRD6O60522 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TDRD6O60522 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TDRD6O60522 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TDRD6O60522 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TDRD6O60522 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TDRD6O60522 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TDRD6O60522 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TDRD6O60522 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TDRD6O60522 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TDRD6O60522 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TDRD6O60522 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TDRD6O60522 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TDRD6O60522 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TDRD6O60522 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TDRD6O60522 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TDRD6O60522 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TDRD6O60522 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TDRD6O60522 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TDRD6O60522 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TDRD6O60522 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TDRD6O60522 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TDRD6O60522 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TDRD6O60522 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TDRD6O60522 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TDRD6O60522 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TDRD6O60522 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms