Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KDELR3O43731 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KDELR3O43731 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KDELR3O43731 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDELR3O43731 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDELR3O43731 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDELR3O43731 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDELR3O43731 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDELR3O43731 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDELR3O43731 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KDELR3O43731 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KDELR3O43731 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KDELR3O43731 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KDELR3O43731 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDELR3O43731 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDELR3O43731 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDELR3O43731 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDELR3O43731 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDELR3O43731 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDELR3O43731 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDELR3O43731 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KDELR3O43731 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
KDELR3O43731 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
KDELR3O43731 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KDELR3O43731 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KDELR3O43731 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KDELR3O43731 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KDELR3O43731 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDELR3O43731 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDELR3O43731 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDELR3O43731 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDELR3O43731 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDELR3O43731 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDELR3O43731 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDELR3O43731 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDELR3O43731 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDELR3O43731 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDELR3O43731 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDELR3O43731 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDELR3O43731 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDELR3O43731 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDELR3O43731 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDELR3O43731 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
KDELR3O43731 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDELR3O43731 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDELR3O43731 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDELR3O43731 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDELR3O43731 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDELR3O43731 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDELR3O43731 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KDELR3O43731 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KDELR3O43731 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDELR3O43731 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDELR3O43731 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDELR3O43731 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDELR3O43731 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDELR3O43731 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDELR3O43731 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDELR3O43731 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
KDELR3O43731 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDELR3O43731 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
KDELR3O43731 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDELR3O43731 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDELR3O43731 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDELR3O43731 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDELR3O43731 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDELR3O43731 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDELR3O43731 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDELR3O43731 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDELR3O43731 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDELR3O43731 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDELR3O43731 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDELR3O43731 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDELR3O43731 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDELR3O43731 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDELR3O43731 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDELR3O43731 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDELR3O43731 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDELR3O43731 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDELR3O43731 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
KDELR3O43731 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDELR3O43731 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDELR3O43731 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDELR3O43731 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDELR3O43731 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDELR3O43731 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDELR3O43731 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDELR3O43731 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDELR3O43731 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDELR3O43731 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDELR3O43731 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDELR3O43731 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDELR3O43731 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDELR3O43731 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
KDELR3O43731 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDELR3O43731 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDELR3O43731 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDELR3O43731 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDELR3O43731 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDELR3O43731 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107 ms