Protein–RNA interactions for Protein: O15055

PER2, Period circadian protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PER2O15055 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PER2O15055 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PER2O15055 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PER2O15055 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PER2O15055 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PER2O15055 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PER2O15055 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PER2O15055 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PER2O15055 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PER2O15055 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PER2O15055 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PER2O15055 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PER2O15055 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PER2O15055 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PER2O15055 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PER2O15055 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PER2O15055 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PER2O15055 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PER2O15055 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PER2O15055 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PER2O15055 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
PER2O15055 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PER2O15055 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PER2O15055 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PER2O15055 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PER2O15055 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PER2O15055 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PER2O15055 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PER2O15055 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PER2O15055 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PER2O15055 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PER2O15055 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PER2O15055 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PER2O15055 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PER2O15055 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PER2O15055 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PER2O15055 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PER2O15055 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PER2O15055 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PER2O15055 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PER2O15055 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PER2O15055 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PER2O15055 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PER2O15055 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PER2O15055 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PER2O15055 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PER2O15055 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PER2O15055 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PER2O15055 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PER2O15055 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PER2O15055 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PER2O15055 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PER2O15055 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PER2O15055 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PER2O15055 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PER2O15055 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PER2O15055 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PER2O15055 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PER2O15055 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PER2O15055 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PER2O15055 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PER2O15055 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PER2O15055 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PER2O15055 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PER2O15055 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PER2O15055 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PER2O15055 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PER2O15055 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PER2O15055 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PER2O15055 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PER2O15055 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PER2O15055 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PER2O15055 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PER2O15055 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PER2O15055 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PER2O15055 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PER2O15055 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PER2O15055 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PER2O15055 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PER2O15055 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PER2O15055 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PER2O15055 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PER2O15055 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PER2O15055 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PER2O15055 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PER2O15055 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PER2O15055 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PER2O15055 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PER2O15055 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PER2O15055 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PER2O15055 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PER2O15055 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PER2O15055 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PER2O15055 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PER2O15055 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PER2O15055 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PER2O15055 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PER2O15055 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PER2O15055 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PER2O15055 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms