Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 MIF4GD-209ENST00000579612 586 ntTSL 313.55□□□□□ -0.241e-14■■■■■ 65.1
DDX3XO00571 CDK16-204ENST00000457458 3158 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.288e-20■■■■■ 65.1
DDX3XO00571 MIF4GD-214ENST00000618645 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.311e-14■■■■■ 65.1
DDX3XO00571 MIF4GD-203ENST00000577240 743 ntTSL 312.72□□□□□ -0.371e-14■■■■■ 65.1
DDX3XO00571 MIF4GD-210ENST00000580099 319 ntTSL 212.2□□□□□ -0.461e-14■■■■■ 65.1
DDX3XO00571 TM2D3-214ENST00000561356 565 ntTSL 46.88□□□□□ -1.311e-14■■■■■ 65.1
DDX3XO00571 HSPA14-203ENST00000441647 578 ntTSL 310.8□□□□□ -0.682e-25■■■■■ 65
DDX3XO00571 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.414e-8■■■■■ 64.9
DDX3XO00571 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.884e-8■■■■■ 64.9
DDX3XO00571 C6orf89-202ENST00000359359 2565 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.024e-8■■■■■ 64.9
DDX3XO00571 C6orf89-204ENST00000480824 6861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.024e-8■■■■■ 64.9
DDX3XO00571 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.641e-38■■■■■ 64.7
DDX3XO00571 ALDOA-207ENST00000562302 502 ntTSL 1 (best)21.21■□□□□ 0.991e-26■■■■■ 64.3
DDX3XO00571 DNAJC14-204ENST00000546957 756 ntTSL 319.25■□□□□ 0.677e-13■■■■■ 64.3
DDX3XO00571 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.27e-13■■■■■ 64.3
DDX3XO00571 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.097e-13■■■■■ 64.3
DDX3XO00571 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.037e-13■■■■■ 64.3
DDX3XO00571 DNAJC14-205ENST00000547445 638 ntTSL 210.76□□□□□ -0.697e-13■■■■■ 64.3
DDX3XO00571 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.251e-13■■■■■ 64.2
DDX3XO00571 VPS36-203ENST00000475375 754 ntTSL 220.14■□□□□ 0.811e-27■■■■■ 64.1
DDX3XO00571 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.622e-13■■■■■ 64.1
DDX3XO00571 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.622e-13■■■■■ 64.1
DDX3XO00571 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.352e-13■■■■■ 64.1
DDX3XO00571 PPP1R18-204ENST00000488324 1328 ntTSL 314.15□□□□□ -0.152e-13■■■■■ 64.1
DDX3XO00571 PPP1R18-202ENST00000399199 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.232e-13■■■■■ 64.1
DDX3XO00571 PPP1R18-203ENST00000467662 1156 ntTSL 312.64□□□□□ -0.392e-13■■■■■ 64.1
DDX3XO00571 VPS36-201ENST00000378060 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.021e-27■■■■■ 64.1
DDX3XO00571 AATK-202ENST00000374792 4938 ntTSL 220.68■□□□□ 0.93e-9■■■■■ 64
DDX3XO00571 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.463e-9■■■■■ 64
DDX3XO00571 AATK-206ENST00000572798 407 ntTSL 213.24□□□□□ -0.293e-9■■■■■ 64
DDX3XO00571 BUD23-207ENST00000430446 738 ntTSL 313.06□□□□□ -0.328e-15■■■■■ 64
DDX3XO00571 TCN1-205ENST00000534531 684 ntTSL 56.23□□□□□ -1.419e-12■■■■■ 63.7
DDX3XO00571 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.469e-12■■■■■ 63.7
DDX3XO00571 TCN1-203ENST00000532419 745 ntTSL 55.37□□□□□ -1.559e-12■■■■■ 63.7
DDX3XO00571 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.116e-25■■■■■ 63.7
DDX3XO00571 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.876e-25■■■■■ 63.7
DDX3XO00571 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.696e-25■■■■■ 63.7
DDX3XO00571 PLEC-214ENST00000528131 564 ntTSL 318.87■□□□□ 0.616e-13■■■■■ 63.7
DDX3XO00571 FOXK2-205ENST00000529652 2199 ntTSL 217.55■□□□□ 0.46e-13■■■■■ 63.7
DDX3XO00571 THOC3-206ENST00000513006 602 ntTSL 316.74■□□□□ 0.276e-25■■■■■ 63.7
DDX3XO00571 FOXK2-212ENST00000624186 4244 nt13.19□□□□□ -0.36e-13■■■■■ 63.7
DDX3XO00571 THOC3-210ENST00000514861 628 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.536e-25■■■■■ 63.7
DDX3XO00571 THOC3-205ENST00000511062 642 ntTSL 310.21□□□□□ -0.776e-25■■■■■ 63.7
DDX3XO00571 THOC3-209ENST00000514250 649 ntTSL 57.4□□□□□ -1.226e-25■■■■■ 63.7
DDX3XO00571 SLC43A1-210ENST00000534105 580 ntTSL 518.16■□□□□ 0.57e-10■■■■■ 63.6
DDX3XO00571 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.377e-10■■■■■ 63.6
DDX3XO00571 SLC43A1-206ENST00000530159 788 ntTSL 517■□□□□ 0.317e-10■■■■■ 63.6
DDX3XO00571 LRRC45-206ENST00000583383 840 ntTSL 325.08■■□□□ 1.616e-7■■■■■ 63.6
DDX3XO00571 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.216e-7■■■■■ 63.6
DDX3XO00571 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.333e-12■■■■■ 63.5
DDX3XO00571 TUSC2-205ENST00000462137 834 ntTSL 322.85■■□□□ 1.251e-13■■■■■ 63.3
DDX3XO00571 ZNF664-210ENST00000541448 567 ntTSL 321.91■■□□□ 1.19e-11■■■■■ 63.3
DDX3XO00571 RFLNA-203ENST00000389727 2385 ntAPPRIS P2 TSL 521.6■■□□□ 1.059e-11■■■■■ 63.3
DDX3XO00571 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.959e-11■■■■■ 63.3
DDX3XO00571 ZNF664-211ENST00000542493 591 ntTSL 418.92■□□□□ 0.629e-11■■■■■ 63.3
DDX3XO00571 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.129e-11■■■■■ 63.3
DDX3XO00571 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.119e-11■■■■■ 63.3
DDX3XO00571 ZNF664-203ENST00000537532 592 ntTSL 413.79□□□□□ -0.29e-11■■■■■ 63.3
DDX3XO00571 ZNF664-213ENST00000543017 455 ntTSL 513.71□□□□□ -0.219e-11■■■■■ 63.3
DDX3XO00571 RFLNA-204ENST00000545615 449 ntTSL 312.74□□□□□ -0.379e-11■■■■■ 63.3
DDX3XO00571 SMIM10L1-201ENST00000622602 4795 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.454e-11■■■■■ 63.1
DDX3XO00571 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.894e-14■■■■■ 63
DDX3XO00571 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.334e-14■■■■■ 63
DDX3XO00571 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.094e-14■■■■■ 63
DDX3XO00571 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.274e-14■■■■■ 63
DDX3XO00571 C1orf131-201ENST00000318906 2483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.394e-14■■■■■ 63
DDX3XO00571 CCDC174-201ENST00000303688 2714 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.434e-14■■■■■ 63
DDX3XO00571 C1orf131-206ENST00000471936 2657 ntTSL 212.35□□□□□ -0.434e-14■■■■■ 63
DDX3XO00571 C1orf131-202ENST00000366649 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.534e-14■■■■■ 63
DDX3XO00571 CCDC174-206ENST00000611584 2720 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.584e-14■■■■■ 63
DDX3XO00571 CCDC174-204ENST00000465759 1139 ntTSL 1 (best)10.29□□□□□ -0.764e-14■■■■■ 63
DDX3XO00571 CCDC174-202ENST00000383794 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.834e-14■■■■■ 63
DDX3XO00571 CCDC174-203ENST00000463438 751 ntTSL 29.48□□□□□ -0.894e-14■■■■■ 63
DDX3XO00571 C1orf131-203ENST00000366651 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.114e-14■■■■■ 63
DDX3XO00571 C1orf131-204ENST00000451322 795 ntAPPRIS ALT2 TSL 56.17□□□□□ -1.424e-14■■■■■ 63
DDX3XO00571 ATP1B2-202ENST00000577026 580 ntTSL 45.9□□□□□ -1.464e-14■■■■■ 63
DDX3XO00571 SMPD1-209ENST00000533196 425 ntTSL 323.79■■□□□ 1.41e-11■■■■■ 63
DDX3XO00571 SMPD1-204ENST00000530395 447 ntTSL 521.04■□□□□ 0.961e-11■■■■■ 63
DDX3XO00571 SMPD1-210ENST00000534405 2446 ntTSL 1 (best)20.37■□□□□ 0.851e-11■■■■■ 63
DDX3XO00571 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.811e-11■■■■■ 63
DDX3XO00571 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.771e-11■■■■■ 63
DDX3XO00571 SMPD1-208ENST00000533123 2211 ntTSL 1 (best)19.79■□□□□ 0.761e-11■■■■■ 63
DDX3XO00571 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.21e-13■■■■■ 62.9
DDX3XO00571 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.671e-13■■■■■ 62.9
DDX3XO00571 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.661e-13■■■■■ 62.9
DDX3XO00571 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.631e-13■■■■■ 62.9
DDX3XO00571 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.541e-13■■■■■ 62.9
DDX3XO00571 TNIP1-216ENST00000522926 464 ntTSL 318.01■□□□□ 0.473e-18■■■■■ 62.9
DDX3XO00571 TNIP1-207ENST00000520695 658 ntTSL 418.01■□□□□ 0.471e-13■■■■■ 62.9
DDX3XO00571 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.441e-13■■■■■ 62.9
DDX3XO00571 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.171e-13■■■■■ 62.9
DDX3XO00571 TNIP1-201ENST00000315050 2785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.21e-13■■■■■ 62.9
DDX3XO00571 TNIP1-218ENST00000523338 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.221e-13■■■■■ 62.9
DDX3XO00571 TNIP1-213ENST00000522100 877 ntTSL 312.4□□□□□ -0.421e-13■■■■■ 62.9
DDX3XO00571 TNIP1-209ENST00000521001 575 ntTSL 410.55□□□□□ -0.721e-13■■■■■ 62.9
DDX3XO00571 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.462e-9■■■■■ 62.7
DDX3XO00571 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.862e-9■■■■■ 62.7
DDX3XO00571 SEC11C-207ENST00000592774 1189 ntTSL 1 (best)17.13■□□□□ 0.336e-45■■■■■ 62.7
DDX3XO00571 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.222e-9■■■■■ 62.7
DDX3XO00571 SEC11C-203ENST00000585864 1088 ntTSL 1 (best)16.22■□□□□ 0.192e-9■■■■■ 62.7
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