Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 SMC4-221ENST00000489573 1553 ntTSL 1 (best)23.19■■□□□ 1.34e-78■■■■■ 527.9
DDX3XO00571 SMC4-209ENST00000468653 1756 ntTSL 220.41■□□□□ 0.864e-78■■■■■ 527.9
DDX3XO00571 SMC4-211ENST00000469858 1971 ntTSL 219.55■□□□□ 0.724e-78■■■■■ 527.9
DDX3XO00571 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.594e-78■■■■■ 527.9
DDX3XO00571 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.234e-78■■■■■ 527.9
DDX3XO00571 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.344e-78■■■■■ 527.9
DDX3XO00571 SMC4-210ENST00000469762 3998 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.614e-78■■■■■ 527.9
DDX3XO00571 SMC4-213ENST00000472282 667 ntTSL 39.5□□□□□ -0.894e-78■■■■■ 527.9
DDX3XO00571 SMC4-214ENST00000472991 582 ntTSL 59.5□□□□□ -0.894e-78■■■■■ 527.9
DDX3XO00571 SMC4-212ENST00000470240 724 ntTSL 38.62□□□□□ -1.034e-78■■■■■ 527.9
DDX3XO00571 SMC4-219ENST00000487747 637 ntTSL 57.07□□□□□ -1.284e-78■■■■■ 527.9
DDX3XO00571 SMC4-227ENST00000497984 563 ntTSL 56.69□□□□□ -1.344e-78■■■■■ 527.9
DDX3XO00571 SMC4-208ENST00000467468 566 ntTSL 45.63□□□□□ -1.514e-78■■■■■ 527.9
DDX3XO00571 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC2.94□□□□□ -1.944e-78■■■■■ 527.9
DDX3XO00571 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC14.44□□□□□ -0.19e-54■■■■■ 339.3
DDX3XO00571 SNORD3B-1-203ENST00000631292 217 nt11.8□□□□□ -0.529e-54■■■■■ 339.3
DDX3XO00571 SNORD3B-1-202ENST00000617128 218 nt11.64□□□□□ -0.559e-54■■■■■ 339.3
DDX3XO00571 HMCN1-204ENST00000485744 1884 ntTSL 210.92□□□□□ -0.664e-72■■■■■ 314.2
DDX3XO00571 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.614e-72■■■■■ 314.2
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DDX3XO00571 PTDSS1-203ENST00000517557 757 ntTSL 222.74■■□□□ 1.235e-44■■■■■ 141
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DDX3XO00571 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.254e-29■■■■■ 128.1
DDX3XO00571 TRANK1-201ENST00000429976 10481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.81e-28■■■■■ 126
DDX3XO00571 PTDSS1-201ENST00000337004 2366 ntTSL 1 (best)23.43■■□□□ 1.347e-20■■■■■ 123.4
DDX3XO00571 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.467e-20■■■■■ 123.4
DDX3XO00571 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.825e-17■■■■■ 120.1
DDX3XO00571 AAED1-203ENST00000446045 2723 ntTSL 1 (best)8.77□□□□□ -1.015e-17■■■■■ 120.1
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DDX3XO00571 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.234e-18■■■■■ 119.7
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DDX3XO00571 GUK1-227ENST00000485083 871 ntTSL 325.16■■□□□ 1.623e-27■■■■■ 118.4
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DDX3XO00571 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.833e-27■■■■■ 118.4
DDX3XO00571 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.813e-27■■■■■ 118.4
DDX3XO00571 GUK1-236ENST00000493209 735 ntTSL 518.86■□□□□ 0.613e-27■■■■■ 118.4
DDX3XO00571 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.593e-27■■■■■ 118.4
DDX3XO00571 GUK1-230ENST00000485838 774 ntTSL 318.11■□□□□ 0.493e-27■■■■■ 118.4
DDX3XO00571 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.293e-27■■■■■ 118.4
DDX3XO00571 GUK1-238ENST00000498092 865 ntTSL 516.25■□□□□ 0.193e-27■■■■■ 118.4
DDX3XO00571 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.13e-27■■■■■ 118.4
DDX3XO00571 GUK1-212ENST00000435153 865 ntTSL 312.71□□□□□ -0.373e-27■■■■■ 118.4
DDX3XO00571 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.552e-23■■■■■ 117.7
DDX3XO00571 APOC1-204ENST00000589078 213 ntTSL 210□□□□□ -0.812e-7■■■■■ 117.3
DDX3XO00571 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.551e-24■■■■■ 114.3
DDX3XO00571 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.52e-23■■■■■ 114.1
DDX3XO00571 DFFA-203ENST00000476658 744 ntTSL 315.56■□□□□ 0.082e-23■■■■■ 114.1
DDX3XO00571 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.22e-23■■■■■ 114.1
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DDX3XO00571 GPR89A-202ENST00000460277 1955 ntTSL 1 (best)18.22■□□□□ 0.512e-22■■■■■ 111.2
DDX3XO00571 GPR89A-211ENST00000528944 866 ntTSL 517.83■□□□□ 0.442e-22■■■■■ 111.2
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DDX3XO00571 GPR89A-201ENST00000313835 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.712e-22■■■■■ 111.2
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DDX3XO00571 PNPLA4-201ENST00000381042 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.452e-17■■■■■ 109.1
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DDX3XO00571 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.442e-17■■■■■ 109.1
DDX3XO00571 TMEM38B-202ENST00000374692 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.342e-8■■■■■ 108.6
DDX3XO00571 TMEM38B-203ENST00000434214 502 ntTSL 210.66□□□□□ -0.72e-8■■■■■ 108.6
DDX3XO00571 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.661e-25■■■■■ 107.6
DDX3XO00571 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.631e-25■■■■■ 107.6
DDX3XO00571 TOR1AIP2-204ENST00000483123 2687 ntTSL 28.62□□□□□ -1.032e-20■■■■■ 106.5
DDX3XO00571 TOR1AIP2-202ENST00000474318 1760 ntTSL 57.82□□□□□ -1.162e-20■■■■■ 106.5
DDX3XO00571 SLC39A9-208ENST00000556125 944 ntTSL 320.13■□□□□ 0.813e-12■■■■■ 105.5
DDX3XO00571 SLC39A9-205ENST00000554059 1763 ntTSL 1 (best)18.43■□□□□ 0.543e-12■■■■■ 105.5
DDX3XO00571 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.223e-12■■■■■ 105.5
DDX3XO00571 SLC39A9-207ENST00000555840 2377 ntTSL 213.23□□□□□ -0.293e-12■■■■■ 105.5
DDX3XO00571 SLC39A9-203ENST00000538956 1264 ntTSL 211.81□□□□□ -0.523e-12■■■■■ 105.5
DDX3XO00571 SLC39A9-201ENST00000031146 5192 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.643e-12■■■■■ 105.5
DDX3XO00571 SLC39A9-202ENST00000336643 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.83e-12■■■■■ 105.5
DDX3XO00571 SLC39A9-211ENST00000628474 3701 ntTSL 59.95□□□□□ -0.823e-12■■■■■ 105.5
DDX3XO00571 SLC39A9-206ENST00000555245 1531 ntTSL 28.11□□□□□ -1.113e-12■■■■■ 105.5
DDX3XO00571 SLC25A23-201ENST00000264088 2056 ntTSL 1 (best)26.23■■□□□ 1.793e-25■■■■■ 105.4
DDX3XO00571 SLC25A23-205ENST00000595267 742 ntTSL 226.23■■□□□ 1.793e-25■■■■■ 105.4
DDX3XO00571 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.793e-25■■■■■ 105.4
DDX3XO00571 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.533e-25■■■■■ 105.4
DDX3XO00571 SLC25A23-208ENST00000597307 557 ntTSL 413.15□□□□□ -0.33e-25■■■■■ 105.4
DDX3XO00571 AGTRAP-214ENST00000514733 919 ntTSL 314.06□□□□□ -0.168e-16■■■■■ 105.1
DDX3XO00571 AGTRAP-213ENST00000513739 566 ntTSL 313.27□□□□□ -0.298e-16■■■■■ 105.1
DDX3XO00571 AGTRAP-207ENST00000471765 717 ntTSL 38.81□□□□□ -18e-16■■■■■ 105.1
DDX3XO00571 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.233e-10■■■■■ 105
DDX3XO00571 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.533e-52■■■■■ 103.9
DDX3XO00571 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.523e-52■■■■■ 103.9
DDX3XO00571 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.43e-52■■■■■ 103.9
DDX3XO00571 FAM50A-205ENST00000481619 763 ntTSL 212.65□□□□□ -0.383e-23■■■■■ 102.9
DDX3XO00571 HES1-202ENST00000476918 1009 ntTSL 218.64■□□□□ 0.579e-23■■■■■ 100.8
DDX3XO00571 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.549e-23■■■■■ 100.8
DDX3XO00571 CD24-207ENST00000621311 257 ntTSL 417.39■□□□□ 0.379e-49■■■■■ 100.8
DDX3XO00571 FLII-230ENST00000628188 156 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.099e-23■■■■■ 100.8
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