RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368494.3

NUS1-201, Transcript of NUS1, dehydrodolichyl diphosphate synthase subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NUS1, Length 4,676 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUS1-201ENST00000368494 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.56■■■□□ 2.48
NUS1-201ENST00000368494 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.46■■■□□ 2.31
NUS1-201ENST00000368494 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.68■■■□□ 2.02
NUS1-201ENST00000368494 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
NUS1-201ENST00000368494 ABCC9O60706 1549 aa26.51■■□□□ 1.83
NUS1-201ENST00000368494 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.24■■□□□ 1.79
NUS1-201ENST00000368494 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.85■■□□□ 1.73
NUS1-201ENST00000368494 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.82■■□□□ 1.72
NUS1-201ENST00000368494 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
NUS1-201ENST00000368494 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.63■■□□□ 1.69
NUS1-201ENST00000368494 TRIM41Q8WV44 630 aa25.48■■□□□ 1.67
NUS1-201ENST00000368494 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
NUS1-201ENST00000368494 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
NUS1-201ENST00000368494 APLP2Q06481 763 aa25.31■■□□□ 1.64
NUS1-201ENST00000368494 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
NUS1-201ENST00000368494 SCRIBQ14160 1630 aa25.11■■□□□ 1.61
NUS1-201ENST00000368494 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.09■■□□□ 1.61
NUS1-201ENST00000368494 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
NUS1-201ENST00000368494 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
NUS1-201ENST00000368494 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
NUS1-201ENST00000368494 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.93■■□□□ 1.58
NUS1-201ENST00000368494 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.88■■□□□ 1.57
NUS1-201ENST00000368494 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
NUS1-201ENST00000368494 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
NUS1-201ENST00000368494 HRCP23327 699 aa24.82■■□□□ 1.56
NUS1-201ENST00000368494 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
NUS1-201ENST00000368494 NACADO15069 1562 aa24.72■■□□□ 1.55
NUS1-201ENST00000368494 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.55
NUS1-201ENST00000368494 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
NUS1-201ENST00000368494 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.38■■□□□ 1.49
NUS1-201ENST00000368494 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
NUS1-201ENST00000368494 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
NUS1-201ENST00000368494 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
NUS1-201ENST00000368494 FBLN2P98095 1184 aa24.16■■□□□ 1.46
NUS1-201ENST00000368494 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
NUS1-201ENST00000368494 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.05■■□□□ 1.44
NUS1-201ENST00000368494 ITGAEP38570 1179 aa24.04■■□□□ 1.44
NUS1-201ENST00000368494 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
NUS1-201ENST00000368494 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.93■■□□□ 1.42
NUS1-201ENST00000368494 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
NUS1-201ENST00000368494 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.88■■□□□ 1.41
NUS1-201ENST00000368494 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.84■■□□□ 1.41
NUS1-201ENST00000368494 NEFLP07196 543 aa23.79■■□□□ 1.4
NUS1-201ENST00000368494 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
NUS1-201ENST00000368494 P3H3Q8IVL6 736 aa23.74■■□□□ 1.39
NUS1-201ENST00000368494 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.7■■□□□ 1.38
NUS1-201ENST00000368494 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.66■■□□□ 1.38
NUS1-201ENST00000368494 ARID3CA6NKF2 412 aa23.62■■□□□ 1.37
NUS1-201ENST00000368494 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
NUS1-201ENST00000368494 ERCC6Q03468 1493 aa23.5■■□□□ 1.35
NUS1-201ENST00000368494 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.48■■□□□ 1.353e-6■□□□□ 9.2
NUS1-201ENST00000368494 SMARCA2P51531 1590 aa23.47■■□□□ 1.35
NUS1-201ENST00000368494 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
NUS1-201ENST00000368494 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.4■■□□□ 1.34
NUS1-201ENST00000368494 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.37■■□□□ 1.33
NUS1-201ENST00000368494 WIZO95785 1651 aa23.34■■□□□ 1.33
NUS1-201ENST00000368494 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.33■■□□□ 1.32
NUS1-201ENST00000368494 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
NUS1-201ENST00000368494 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.32■■□□□ 1.32
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NUS1-201ENST00000368494 NEUROD1Q13562 356 aa23.3■■□□□ 1.32
NUS1-201ENST00000368494 MYT1Q01538 1121 aa23.3■■□□□ 1.32
NUS1-201ENST00000368494 SMARCA4P51532 1647 aa23.26■■□□□ 1.31
NUS1-201ENST00000368494 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
NUS1-201ENST00000368494 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
NUS1-201ENST00000368494 KIF27Q86VH2 1401 aa23.19■■□□□ 1.3
NUS1-201ENST00000368494 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.18■■□□□ 1.3
NUS1-201ENST00000368494 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
NUS1-201ENST00000368494 TRIM52Q96A61 297 aa23.17■■□□□ 1.3
NUS1-201ENST00000368494 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.15■■□□□ 1.3
NUS1-201ENST00000368494 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.14■■□□□ 1.3
NUS1-201ENST00000368494 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
NUS1-201ENST00000368494 EEA1Q15075 1411 aa23.1■■□□□ 1.29
NUS1-201ENST00000368494 ABCC8Q09428 1581 aa23.05■■□□□ 1.28
NUS1-201ENST00000368494 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
NUS1-201ENST00000368494 CUX2O14529 1486 aa23.04■■□□□ 1.28
NUS1-201ENST00000368494 CLIP1P30622 1438 aa23.02■■□□□ 1.28
NUS1-201ENST00000368494 GOLGA3Q08378 1498 aa22.98■■□□□ 1.27
NUS1-201ENST00000368494 SOGA1O94964 1423 aa22.98■■□□□ 1.27
NUS1-201ENST00000368494 BCANQ96GW7 911 aa22.97■■□□□ 1.27
NUS1-201ENST00000368494 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
NUS1-201ENST00000368494 ANP32CO43423 234 aa22.95■■□□□ 1.26
NUS1-201ENST00000368494 NCAPD3P42695 1498 aa22.91■■□□□ 1.26
NUS1-201ENST00000368494 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.9■■□□□ 1.26
NUS1-201ENST00000368494 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.89■■□□□ 1.25
NUS1-201ENST00000368494 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.86■■□□□ 1.25
NUS1-201ENST00000368494 CEP162Q5TB80 1403 aa22.86■■□□□ 1.25
NUS1-201ENST00000368494 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
NUS1-201ENST00000368494 KCNH8Q96L42 1107 aa22.84■■□□□ 1.25
NUS1-201ENST00000368494 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.83■■□□□ 1.25
NUS1-201ENST00000368494 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.78■■□□□ 1.24
NUS1-201ENST00000368494 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.77■■□□□ 1.24
NUS1-201ENST00000368494 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.76■■□□□ 1.23
NUS1-201ENST00000368494 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.75■■□□□ 1.23
NUS1-201ENST00000368494 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.74■■□□□ 1.23
NUS1-201ENST00000368494 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
NUS1-201ENST00000368494 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.71■■□□□ 1.23
NUS1-201ENST00000368494 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
NUS1-201ENST00000368494 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
NUS1-201ENST00000368494 TSPY4P0CV99 314 aa22.65■■□□□ 1.22
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