Protein–RNA interactions for Protein: O00472

ELL2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL2O00472 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ELL2O00472 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ELL2O00472 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
ELL2O00472 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ELL2O00472 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ELL2O00472 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ELL2O00472 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ELL2O00472 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ELL2O00472 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ELL2O00472 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ELL2O00472 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ELL2O00472 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ELL2O00472 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ELL2O00472 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ELL2O00472 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ELL2O00472 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ELL2O00472 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
ELL2O00472 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
ELL2O00472 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
ELL2O00472 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
ELL2O00472 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
ELL2O00472 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ELL2O00472 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ELL2O00472 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ELL2O00472 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
ELL2O00472 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
ELL2O00472 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
ELL2O00472 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
ELL2O00472 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
ELL2O00472 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ELL2O00472 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ELL2O00472 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
ELL2O00472 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
ELL2O00472 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ELL2O00472 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ELL2O00472 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
ELL2O00472 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
ELL2O00472 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.85■■■□□ 2.85
ELL2O00472 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
ELL2O00472 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
ELL2O00472 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ELL2O00472 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ELL2O00472 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
ELL2O00472 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
ELL2O00472 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
ELL2O00472 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
ELL2O00472 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
ELL2O00472 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
ELL2O00472 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ELL2O00472 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
ELL2O00472 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ELL2O00472 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ELL2O00472 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ELL2O00472 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ELL2O00472 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ELL2O00472 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ELL2O00472 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ELL2O00472 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ELL2O00472 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
ELL2O00472 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
ELL2O00472 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ELL2O00472 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ELL2O00472 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ELL2O00472 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ELL2O00472 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ELL2O00472 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ELL2O00472 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ELL2O00472 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ELL2O00472 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ELL2O00472 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ELL2O00472 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ELL2O00472 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ELL2O00472 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ELL2O00472 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ELL2O00472 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
ELL2O00472 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ELL2O00472 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ELL2O00472 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ELL2O00472 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ELL2O00472 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ELL2O00472 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ELL2O00472 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ELL2O00472 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ELL2O00472 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
ELL2O00472 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ELL2O00472 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
ELL2O00472 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
ELL2O00472 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
ELL2O00472 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
ELL2O00472 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ELL2O00472 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ELL2O00472 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ELL2O00472 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ELL2O00472 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
ELL2O00472 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
ELL2O00472 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
ELL2O00472 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
ELL2O00472 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
ELL2O00472 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
ELL2O00472 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms