Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GFRA2O00451 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GFRA2O00451 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GFRA2O00451 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GFRA2O00451 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GFRA2O00451 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GFRA2O00451 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GFRA2O00451 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GFRA2O00451 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GFRA2O00451 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GFRA2O00451 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GFRA2O00451 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GFRA2O00451 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GFRA2O00451 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GFRA2O00451 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
GFRA2O00451 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GFRA2O00451 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GFRA2O00451 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GFRA2O00451 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GFRA2O00451 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GFRA2O00451 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GFRA2O00451 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GFRA2O00451 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GFRA2O00451 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GFRA2O00451 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GFRA2O00451 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GFRA2O00451 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GFRA2O00451 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GFRA2O00451 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GFRA2O00451 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GFRA2O00451 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GFRA2O00451 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GFRA2O00451 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GFRA2O00451 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GFRA2O00451 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GFRA2O00451 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GFRA2O00451 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GFRA2O00451 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GFRA2O00451 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GFRA2O00451 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GFRA2O00451 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GFRA2O00451 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GFRA2O00451 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GFRA2O00451 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GFRA2O00451 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GFRA2O00451 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GFRA2O00451 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GFRA2O00451 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GFRA2O00451 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GFRA2O00451 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GFRA2O00451 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GFRA2O00451 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GFRA2O00451 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GFRA2O00451 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GFRA2O00451 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GFRA2O00451 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GFRA2O00451 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GFRA2O00451 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GFRA2O00451 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GFRA2O00451 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GFRA2O00451 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GFRA2O00451 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GFRA2O00451 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GFRA2O00451 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GFRA2O00451 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GFRA2O00451 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GFRA2O00451 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GFRA2O00451 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GFRA2O00451 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GFRA2O00451 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GFRA2O00451 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GFRA2O00451 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GFRA2O00451 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GFRA2O00451 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GFRA2O00451 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
GFRA2O00451 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
GFRA2O00451 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GFRA2O00451 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GFRA2O00451 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GFRA2O00451 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GFRA2O00451 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GFRA2O00451 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GFRA2O00451 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GFRA2O00451 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GFRA2O00451 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GFRA2O00451 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GFRA2O00451 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GFRA2O00451 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GFRA2O00451 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GFRA2O00451 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GFRA2O00451 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GFRA2O00451 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GFRA2O00451 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GFRA2O00451 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GFRA2O00451 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GFRA2O00451 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GFRA2O00451 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GFRA2O00451 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GFRA2O00451 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GFRA2O00451 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms