Protein–RNA interactions for Protein: O00255

MEN1, Menin, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEN1O00255 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MEN1O00255 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MEN1O00255 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MEN1O00255 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MEN1O00255 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MEN1O00255 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MEN1O00255 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MEN1O00255 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MEN1O00255 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MEN1O00255 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MEN1O00255 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MEN1O00255 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MEN1O00255 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MEN1O00255 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MEN1O00255 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MEN1O00255 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MEN1O00255 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MEN1O00255 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MEN1O00255 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MEN1O00255 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MEN1O00255 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MEN1O00255 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MEN1O00255 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MEN1O00255 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEN1O00255 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEN1O00255 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEN1O00255 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEN1O00255 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEN1O00255 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEN1O00255 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MEN1O00255 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MEN1O00255 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MEN1O00255 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MEN1O00255 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MEN1O00255 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MEN1O00255 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MEN1O00255 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MEN1O00255 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MEN1O00255 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MEN1O00255 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MEN1O00255 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MEN1O00255 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MEN1O00255 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MEN1O00255 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MEN1O00255 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MEN1O00255 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MEN1O00255 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MEN1O00255 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MEN1O00255 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MEN1O00255 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MEN1O00255 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MEN1O00255 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MEN1O00255 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MEN1O00255 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MEN1O00255 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MEN1O00255 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MEN1O00255 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MEN1O00255 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MEN1O00255 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MEN1O00255 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MEN1O00255 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MEN1O00255 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MEN1O00255 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MEN1O00255 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MEN1O00255 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MEN1O00255 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEN1O00255 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEN1O00255 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEN1O00255 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEN1O00255 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEN1O00255 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MEN1O00255 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MEN1O00255 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MEN1O00255 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MEN1O00255 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MEN1O00255 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MEN1O00255 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MEN1O00255 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MEN1O00255 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MEN1O00255 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MEN1O00255 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MEN1O00255 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MEN1O00255 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MEN1O00255 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEN1O00255 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEN1O00255 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MEN1O00255 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MEN1O00255 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MEN1O00255 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MEN1O00255 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MEN1O00255 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MEN1O00255 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MEN1O00255 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MEN1O00255 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MEN1O00255 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MEN1O00255 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MEN1O00255 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MEN1O00255 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MEN1O00255 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MEN1O00255 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms