Protein–RNA interactions for Protein: J3QLW9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QLW9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
J3QLW9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
J3QLW9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
J3QLW9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
J3QLW9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
J3QLW9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
J3QLW9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
J3QLW9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
J3QLW9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
J3QLW9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
J3QLW9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
J3QLW9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
J3QLW9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
J3QLW9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
J3QLW9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
J3QLW9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
J3QLW9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
J3QLW9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
J3QLW9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
J3QLW9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
J3QLW9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
J3QLW9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
J3QLW9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
J3QLW9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
J3QLW9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
J3QLW9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
J3QLW9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
J3QLW9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
J3QLW9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
J3QLW9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
J3QLW9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
J3QLW9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
J3QLW9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
J3QLW9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
J3QLW9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
J3QLW9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
J3QLW9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
J3QLW9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
J3QLW9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
J3QLW9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
J3QLW9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
J3QLW9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
J3QLW9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
J3QLW9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
J3QLW9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
J3QLW9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
J3QLW9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
J3QLW9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
J3QLW9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
J3QLW9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
J3QLW9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
J3QLW9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
J3QLW9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
J3QLW9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
J3QLW9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
J3QLW9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
J3QLW9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
J3QLW9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
J3QLW9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
J3QLW9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
J3QLW9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
J3QLW9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
J3QLW9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
J3QLW9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
J3QLW9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
J3QLW9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
J3QLW9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
J3QLW9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
J3QLW9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
J3QLW9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
J3QLW9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
J3QLW9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
J3QLW9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
J3QLW9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
J3QLW9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
J3QLW9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
J3QLW9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
J3QLW9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
J3QLW9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
J3QLW9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
J3QLW9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
J3QLW9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
J3QLW9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
J3QLW9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
J3QLW9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
J3QLW9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
J3QLW9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
J3QLW9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
J3QLW9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
J3QLW9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
J3QLW9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
J3QLW9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
J3QLW9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
J3QLW9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
J3QLW9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
J3QLW9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
J3QLW9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
J3QLW9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
J3QLW9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
J3QLW9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms