Protein–RNA interactions for Protein: H3BNC9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNC9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
H3BNC9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
H3BNC9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
H3BNC9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
H3BNC9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
H3BNC9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
H3BNC9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
H3BNC9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
H3BNC9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
H3BNC9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
H3BNC9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
H3BNC9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
H3BNC9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
H3BNC9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
H3BNC9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
H3BNC9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
H3BNC9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
H3BNC9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
H3BNC9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
H3BNC9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
H3BNC9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
H3BNC9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
H3BNC9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
H3BNC9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
H3BNC9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
H3BNC9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
H3BNC9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
H3BNC9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
H3BNC9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
H3BNC9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
H3BNC9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
H3BNC9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
H3BNC9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
H3BNC9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
H3BNC9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
H3BNC9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
H3BNC9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
H3BNC9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
H3BNC9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
H3BNC9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
H3BNC9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
H3BNC9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
H3BNC9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
H3BNC9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
H3BNC9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
H3BNC9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
H3BNC9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
H3BNC9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
H3BNC9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
H3BNC9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
H3BNC9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
H3BNC9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
H3BNC9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
H3BNC9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
H3BNC9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
H3BNC9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
H3BNC9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
H3BNC9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
H3BNC9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
H3BNC9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
H3BNC9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
H3BNC9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
H3BNC9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
H3BNC9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
H3BNC9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
H3BNC9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
H3BNC9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
H3BNC9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
H3BNC9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
H3BNC9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
H3BNC9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
H3BNC9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
H3BNC9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
H3BNC9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
H3BNC9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
H3BNC9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
H3BNC9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
H3BNC9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
H3BNC9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
H3BNC9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
H3BNC9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
H3BNC9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
H3BNC9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
H3BNC9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
H3BNC9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
H3BNC9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
H3BNC9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
H3BNC9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
H3BNC9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
H3BNC9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
H3BNC9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
H3BNC9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
H3BNC9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
H3BNC9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
H3BNC9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
H3BNC9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
H3BNC9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
H3BNC9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
H3BNC9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
H3BNC9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms