Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SOBPA7XYQ1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SOBPA7XYQ1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SOBPA7XYQ1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SOBPA7XYQ1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SOBPA7XYQ1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SOBPA7XYQ1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SOBPA7XYQ1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SOBPA7XYQ1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SOBPA7XYQ1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SOBPA7XYQ1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SOBPA7XYQ1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SOBPA7XYQ1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SOBPA7XYQ1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SOBPA7XYQ1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SOBPA7XYQ1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SOBPA7XYQ1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SOBPA7XYQ1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SOBPA7XYQ1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SOBPA7XYQ1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SOBPA7XYQ1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SOBPA7XYQ1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SOBPA7XYQ1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SOBPA7XYQ1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SOBPA7XYQ1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SOBPA7XYQ1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SOBPA7XYQ1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
SOBPA7XYQ1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SOBPA7XYQ1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SOBPA7XYQ1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SOBPA7XYQ1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SOBPA7XYQ1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SOBPA7XYQ1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SOBPA7XYQ1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SOBPA7XYQ1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SOBPA7XYQ1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SOBPA7XYQ1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SOBPA7XYQ1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SOBPA7XYQ1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SOBPA7XYQ1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SOBPA7XYQ1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SOBPA7XYQ1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SOBPA7XYQ1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SOBPA7XYQ1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SOBPA7XYQ1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SOBPA7XYQ1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SOBPA7XYQ1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SOBPA7XYQ1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SOBPA7XYQ1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SOBPA7XYQ1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SOBPA7XYQ1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SOBPA7XYQ1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SOBPA7XYQ1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SOBPA7XYQ1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SOBPA7XYQ1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SOBPA7XYQ1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SOBPA7XYQ1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SOBPA7XYQ1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SOBPA7XYQ1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SOBPA7XYQ1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SOBPA7XYQ1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SOBPA7XYQ1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SOBPA7XYQ1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SOBPA7XYQ1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SOBPA7XYQ1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SOBPA7XYQ1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SOBPA7XYQ1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SOBPA7XYQ1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SOBPA7XYQ1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SOBPA7XYQ1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SOBPA7XYQ1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SOBPA7XYQ1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SOBPA7XYQ1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SOBPA7XYQ1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SOBPA7XYQ1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SOBPA7XYQ1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SOBPA7XYQ1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SOBPA7XYQ1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SOBPA7XYQ1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SOBPA7XYQ1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SOBPA7XYQ1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SOBPA7XYQ1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SOBPA7XYQ1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SOBPA7XYQ1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SOBPA7XYQ1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SOBPA7XYQ1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SOBPA7XYQ1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SOBPA7XYQ1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SOBPA7XYQ1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SOBPA7XYQ1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SOBPA7XYQ1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SOBPA7XYQ1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SOBPA7XYQ1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SOBPA7XYQ1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SOBPA7XYQ1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SOBPA7XYQ1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SOBPA7XYQ1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SOBPA7XYQ1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SOBPA7XYQ1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SOBPA7XYQ1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
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