Protein–RNA interactions for Protein: A4FU28

CTAGE9, cTAGE family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE9A4FU28 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTAGE9A4FU28 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTAGE9A4FU28 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTAGE9A4FU28 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTAGE9A4FU28 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTAGE9A4FU28 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTAGE9A4FU28 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTAGE9A4FU28 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CTAGE9A4FU28 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTAGE9A4FU28 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTAGE9A4FU28 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTAGE9A4FU28 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTAGE9A4FU28 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTAGE9A4FU28 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTAGE9A4FU28 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTAGE9A4FU28 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTAGE9A4FU28 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CTAGE9A4FU28 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CTAGE9A4FU28 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CTAGE9A4FU28 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTAGE9A4FU28 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTAGE9A4FU28 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTAGE9A4FU28 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTAGE9A4FU28 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTAGE9A4FU28 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTAGE9A4FU28 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTAGE9A4FU28 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTAGE9A4FU28 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTAGE9A4FU28 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTAGE9A4FU28 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTAGE9A4FU28 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CTAGE9A4FU28 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CTAGE9A4FU28 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTAGE9A4FU28 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTAGE9A4FU28 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTAGE9A4FU28 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTAGE9A4FU28 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTAGE9A4FU28 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTAGE9A4FU28 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTAGE9A4FU28 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTAGE9A4FU28 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTAGE9A4FU28 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTAGE9A4FU28 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTAGE9A4FU28 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTAGE9A4FU28 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTAGE9A4FU28 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTAGE9A4FU28 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTAGE9A4FU28 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTAGE9A4FU28 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTAGE9A4FU28 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTAGE9A4FU28 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTAGE9A4FU28 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTAGE9A4FU28 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTAGE9A4FU28 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CTAGE9A4FU28 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CTAGE9A4FU28 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTAGE9A4FU28 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTAGE9A4FU28 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTAGE9A4FU28 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTAGE9A4FU28 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CTAGE9A4FU28 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTAGE9A4FU28 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTAGE9A4FU28 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTAGE9A4FU28 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTAGE9A4FU28 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTAGE9A4FU28 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTAGE9A4FU28 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTAGE9A4FU28 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTAGE9A4FU28 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTAGE9A4FU28 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTAGE9A4FU28 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTAGE9A4FU28 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTAGE9A4FU28 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTAGE9A4FU28 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTAGE9A4FU28 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTAGE9A4FU28 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTAGE9A4FU28 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTAGE9A4FU28 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTAGE9A4FU28 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTAGE9A4FU28 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTAGE9A4FU28 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTAGE9A4FU28 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTAGE9A4FU28 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTAGE9A4FU28 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTAGE9A4FU28 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTAGE9A4FU28 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTAGE9A4FU28 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTAGE9A4FU28 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTAGE9A4FU28 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTAGE9A4FU28 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTAGE9A4FU28 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTAGE9A4FU28 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTAGE9A4FU28 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTAGE9A4FU28 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTAGE9A4FU28 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CTAGE9A4FU28 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTAGE9A4FU28 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTAGE9A4FU28 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTAGE9A4FU28 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CTAGE9A4FU28 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms