Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQJ8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQJ8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
A0A0U1RQJ8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
A0A0U1RQJ8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
A0A0U1RQJ8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
A0A0U1RQJ8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
A0A0U1RQJ8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
A0A0U1RQJ8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
A0A0U1RQJ8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
A0A0U1RQJ8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
A0A0U1RQJ8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
A0A0U1RQJ8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
A0A0U1RQJ8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
A0A0U1RQJ8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
A0A0U1RQJ8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
A0A0U1RQJ8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
A0A0U1RQJ8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
A0A0U1RQJ8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
A0A0U1RQJ8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
A0A0U1RQJ8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
A0A0U1RQJ8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A0U1RQJ8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A0U1RQJ8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A0U1RQJ8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
A0A0U1RQJ8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A0U1RQJ8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A0U1RQJ8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A0U1RQJ8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A0U1RQJ8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A0U1RQJ8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A0U1RQJ8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A0U1RQJ8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A0U1RQJ8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
A0A0U1RQJ8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
A0A0U1RQJ8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A0U1RQJ8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A0U1RQJ8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A0U1RQJ8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A0U1RQJ8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A0U1RQJ8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A0U1RQJ8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A0U1RQJ8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
A0A0U1RQJ8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
A0A0U1RQJ8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
A0A0U1RQJ8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
A0A0U1RQJ8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
A0A0U1RQJ8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
A0A0U1RQJ8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
A0A0U1RQJ8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
A0A0U1RQJ8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
A0A0U1RQJ8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
A0A0U1RQJ8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
A0A0U1RQJ8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
A0A0U1RQJ8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
A0A0U1RQJ8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
A0A0U1RQJ8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
A0A0U1RQJ8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
A0A0U1RQJ8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A0U1RQJ8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A0U1RQJ8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A0U1RQJ8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A0U1RQJ8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A0U1RQJ8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A0U1RQJ8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A0U1RQJ8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A0U1RQJ8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
A0A0U1RQJ8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
A0A0U1RQJ8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
A0A0U1RQJ8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
A0A0U1RQJ8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
A0A0U1RQJ8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A0U1RQJ8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A0U1RQJ8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A0U1RQJ8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
A0A0U1RQJ8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
A0A0U1RQJ8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
A0A0U1RQJ8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
A0A0U1RQJ8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
A0A0U1RQJ8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
A0A0U1RQJ8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
A0A0U1RQJ8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
A0A0U1RQJ8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
A0A0U1RQJ8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
A0A0U1RQJ8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A0U1RQJ8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A0U1RQJ8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A0U1RQJ8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A0U1RQJ8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
A0A0U1RQJ8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
A0A0U1RQJ8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
A0A0U1RQJ8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
A0A0U1RQJ8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
A0A0U1RQJ8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
A0A0U1RQJ8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
A0A0U1RQJ8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
A0A0U1RQJ8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A0U1RQJ8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A0U1RQJ8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
A0A0U1RQJ8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
A0A0U1RQJ8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
A0A0U1RQJ8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms