Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6A4

CFAP20, Cilia- and flagella-associated protein 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP20Q9Y6A4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP20Q9Y6A4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP20Q9Y6A4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CFAP20Q9Y6A4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP20Q9Y6A4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP20Q9Y6A4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP20Q9Y6A4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP20Q9Y6A4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP20Q9Y6A4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP20Q9Y6A4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP20Q9Y6A4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP20Q9Y6A4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP20Q9Y6A4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP20Q9Y6A4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP20Q9Y6A4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP20Q9Y6A4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP20Q9Y6A4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP20Q9Y6A4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP20Q9Y6A4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP20Q9Y6A4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP20Q9Y6A4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP20Q9Y6A4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP20Q9Y6A4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP20Q9Y6A4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP20Q9Y6A4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP20Q9Y6A4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP20Q9Y6A4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP20Q9Y6A4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP20Q9Y6A4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP20Q9Y6A4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP20Q9Y6A4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP20Q9Y6A4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP20Q9Y6A4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP20Q9Y6A4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP20Q9Y6A4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP20Q9Y6A4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP20Q9Y6A4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP20Q9Y6A4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP20Q9Y6A4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP20Q9Y6A4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP20Q9Y6A4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP20Q9Y6A4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP20Q9Y6A4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CFAP20Q9Y6A4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP20Q9Y6A4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP20Q9Y6A4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP20Q9Y6A4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP20Q9Y6A4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP20Q9Y6A4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP20Q9Y6A4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP20Q9Y6A4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP20Q9Y6A4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP20Q9Y6A4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP20Q9Y6A4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP20Q9Y6A4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP20Q9Y6A4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP20Q9Y6A4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP20Q9Y6A4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP20Q9Y6A4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP20Q9Y6A4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP20Q9Y6A4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP20Q9Y6A4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP20Q9Y6A4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP20Q9Y6A4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP20Q9Y6A4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP20Q9Y6A4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP20Q9Y6A4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP20Q9Y6A4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP20Q9Y6A4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP20Q9Y6A4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP20Q9Y6A4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP20Q9Y6A4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP20Q9Y6A4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP20Q9Y6A4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP20Q9Y6A4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP20Q9Y6A4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP20Q9Y6A4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP20Q9Y6A4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP20Q9Y6A4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP20Q9Y6A4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP20Q9Y6A4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP20Q9Y6A4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP20Q9Y6A4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP20Q9Y6A4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP20Q9Y6A4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP20Q9Y6A4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP20Q9Y6A4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP20Q9Y6A4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP20Q9Y6A4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP20Q9Y6A4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP20Q9Y6A4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP20Q9Y6A4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP20Q9Y6A4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP20Q9Y6A4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP20Q9Y6A4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP20Q9Y6A4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP20Q9Y6A4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP20Q9Y6A4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP20Q9Y6A4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP20Q9Y6A4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms