Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
R3HCC1Q9Y3T6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
R3HCC1Q9Y3T6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
R3HCC1Q9Y3T6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
R3HCC1Q9Y3T6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
R3HCC1Q9Y3T6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
R3HCC1Q9Y3T6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
R3HCC1Q9Y3T6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
R3HCC1Q9Y3T6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
R3HCC1Q9Y3T6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
R3HCC1Q9Y3T6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
R3HCC1Q9Y3T6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
R3HCC1Q9Y3T6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
R3HCC1Q9Y3T6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
R3HCC1Q9Y3T6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
R3HCC1Q9Y3T6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
R3HCC1Q9Y3T6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
R3HCC1Q9Y3T6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
R3HCC1Q9Y3T6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
R3HCC1Q9Y3T6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
R3HCC1Q9Y3T6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
R3HCC1Q9Y3T6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
R3HCC1Q9Y3T6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
R3HCC1Q9Y3T6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
R3HCC1Q9Y3T6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
R3HCC1Q9Y3T6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
R3HCC1Q9Y3T6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
R3HCC1Q9Y3T6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
R3HCC1Q9Y3T6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
R3HCC1Q9Y3T6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
R3HCC1Q9Y3T6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
R3HCC1Q9Y3T6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
R3HCC1Q9Y3T6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
R3HCC1Q9Y3T6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
R3HCC1Q9Y3T6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
R3HCC1Q9Y3T6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
R3HCC1Q9Y3T6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
R3HCC1Q9Y3T6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
R3HCC1Q9Y3T6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
R3HCC1Q9Y3T6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
R3HCC1Q9Y3T6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
R3HCC1Q9Y3T6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
R3HCC1Q9Y3T6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
R3HCC1Q9Y3T6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
R3HCC1Q9Y3T6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
R3HCC1Q9Y3T6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
R3HCC1Q9Y3T6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
R3HCC1Q9Y3T6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
R3HCC1Q9Y3T6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
R3HCC1Q9Y3T6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
R3HCC1Q9Y3T6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
R3HCC1Q9Y3T6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
R3HCC1Q9Y3T6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
R3HCC1Q9Y3T6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
R3HCC1Q9Y3T6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
R3HCC1Q9Y3T6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
R3HCC1Q9Y3T6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
R3HCC1Q9Y3T6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
R3HCC1Q9Y3T6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
R3HCC1Q9Y3T6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
R3HCC1Q9Y3T6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
R3HCC1Q9Y3T6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
R3HCC1Q9Y3T6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
R3HCC1Q9Y3T6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
R3HCC1Q9Y3T6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
R3HCC1Q9Y3T6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
R3HCC1Q9Y3T6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
R3HCC1Q9Y3T6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
R3HCC1Q9Y3T6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
R3HCC1Q9Y3T6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
R3HCC1Q9Y3T6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
R3HCC1Q9Y3T6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
R3HCC1Q9Y3T6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
R3HCC1Q9Y3T6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
R3HCC1Q9Y3T6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
R3HCC1Q9Y3T6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
R3HCC1Q9Y3T6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
R3HCC1Q9Y3T6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
R3HCC1Q9Y3T6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
R3HCC1Q9Y3T6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
R3HCC1Q9Y3T6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
R3HCC1Q9Y3T6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
R3HCC1Q9Y3T6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
R3HCC1Q9Y3T6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
R3HCC1Q9Y3T6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
R3HCC1Q9Y3T6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
R3HCC1Q9Y3T6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
R3HCC1Q9Y3T6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
R3HCC1Q9Y3T6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
R3HCC1Q9Y3T6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
R3HCC1Q9Y3T6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
R3HCC1Q9Y3T6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
R3HCC1Q9Y3T6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
R3HCC1Q9Y3T6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
R3HCC1Q9Y3T6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
R3HCC1Q9Y3T6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
R3HCC1Q9Y3T6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
R3HCC1Q9Y3T6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
R3HCC1Q9Y3T6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
R3HCC1Q9Y3T6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms