Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQV4

LAMP3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP3Q9UQV4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMP3Q9UQV4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMP3Q9UQV4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMP3Q9UQV4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMP3Q9UQV4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMP3Q9UQV4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMP3Q9UQV4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMP3Q9UQV4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMP3Q9UQV4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMP3Q9UQV4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMP3Q9UQV4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMP3Q9UQV4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMP3Q9UQV4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMP3Q9UQV4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMP3Q9UQV4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMP3Q9UQV4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMP3Q9UQV4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMP3Q9UQV4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMP3Q9UQV4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMP3Q9UQV4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMP3Q9UQV4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMP3Q9UQV4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMP3Q9UQV4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMP3Q9UQV4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMP3Q9UQV4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LAMP3Q9UQV4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMP3Q9UQV4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMP3Q9UQV4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMP3Q9UQV4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMP3Q9UQV4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMP3Q9UQV4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMP3Q9UQV4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMP3Q9UQV4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMP3Q9UQV4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMP3Q9UQV4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMP3Q9UQV4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMP3Q9UQV4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMP3Q9UQV4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMP3Q9UQV4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMP3Q9UQV4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMP3Q9UQV4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMP3Q9UQV4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMP3Q9UQV4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMP3Q9UQV4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMP3Q9UQV4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMP3Q9UQV4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMP3Q9UQV4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMP3Q9UQV4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMP3Q9UQV4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMP3Q9UQV4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMP3Q9UQV4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMP3Q9UQV4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMP3Q9UQV4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMP3Q9UQV4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMP3Q9UQV4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMP3Q9UQV4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LAMP3Q9UQV4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMP3Q9UQV4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMP3Q9UQV4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMP3Q9UQV4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMP3Q9UQV4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMP3Q9UQV4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMP3Q9UQV4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMP3Q9UQV4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMP3Q9UQV4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMP3Q9UQV4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMP3Q9UQV4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMP3Q9UQV4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMP3Q9UQV4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMP3Q9UQV4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMP3Q9UQV4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMP3Q9UQV4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMP3Q9UQV4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMP3Q9UQV4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMP3Q9UQV4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMP3Q9UQV4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMP3Q9UQV4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMP3Q9UQV4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMP3Q9UQV4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMP3Q9UQV4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMP3Q9UQV4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMP3Q9UQV4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMP3Q9UQV4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMP3Q9UQV4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMP3Q9UQV4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMP3Q9UQV4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMP3Q9UQV4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LAMP3Q9UQV4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMP3Q9UQV4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMP3Q9UQV4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMP3Q9UQV4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMP3Q9UQV4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMP3Q9UQV4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMP3Q9UQV4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMP3Q9UQV4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMP3Q9UQV4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMP3Q9UQV4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMP3Q9UQV4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMP3Q9UQV4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMP3Q9UQV4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms