Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPC5

GPR34, Probable G-protein coupled receptor 34, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR34Q9UPC5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPR34Q9UPC5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPR34Q9UPC5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPR34Q9UPC5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPR34Q9UPC5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPR34Q9UPC5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPR34Q9UPC5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPR34Q9UPC5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPR34Q9UPC5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPR34Q9UPC5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPR34Q9UPC5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GPR34Q9UPC5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPR34Q9UPC5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPR34Q9UPC5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPR34Q9UPC5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPR34Q9UPC5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPR34Q9UPC5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPR34Q9UPC5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPR34Q9UPC5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GPR34Q9UPC5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPR34Q9UPC5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPR34Q9UPC5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPR34Q9UPC5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GPR34Q9UPC5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPR34Q9UPC5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPR34Q9UPC5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPR34Q9UPC5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPR34Q9UPC5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPR34Q9UPC5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPR34Q9UPC5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPR34Q9UPC5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPR34Q9UPC5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPR34Q9UPC5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPR34Q9UPC5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPR34Q9UPC5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPR34Q9UPC5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPR34Q9UPC5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPR34Q9UPC5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPR34Q9UPC5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GPR34Q9UPC5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPR34Q9UPC5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPR34Q9UPC5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPR34Q9UPC5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPR34Q9UPC5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPR34Q9UPC5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPR34Q9UPC5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPR34Q9UPC5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GPR34Q9UPC5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPR34Q9UPC5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPR34Q9UPC5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPR34Q9UPC5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPR34Q9UPC5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPR34Q9UPC5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GPR34Q9UPC5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPR34Q9UPC5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GPR34Q9UPC5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPR34Q9UPC5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPR34Q9UPC5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPR34Q9UPC5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPR34Q9UPC5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPR34Q9UPC5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPR34Q9UPC5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPR34Q9UPC5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPR34Q9UPC5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GPR34Q9UPC5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPR34Q9UPC5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPR34Q9UPC5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPR34Q9UPC5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPR34Q9UPC5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPR34Q9UPC5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPR34Q9UPC5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPR34Q9UPC5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPR34Q9UPC5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GPR34Q9UPC5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPR34Q9UPC5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPR34Q9UPC5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPR34Q9UPC5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPR34Q9UPC5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPR34Q9UPC5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPR34Q9UPC5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPR34Q9UPC5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPR34Q9UPC5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPR34Q9UPC5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPR34Q9UPC5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPR34Q9UPC5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPR34Q9UPC5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPR34Q9UPC5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPR34Q9UPC5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPR34Q9UPC5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPR34Q9UPC5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPR34Q9UPC5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPR34Q9UPC5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPR34Q9UPC5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPR34Q9UPC5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPR34Q9UPC5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPR34Q9UPC5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPR34Q9UPC5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPR34Q9UPC5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPR34Q9UPC5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPR34Q9UPC5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms