Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNTNAP2Q9UHC6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNTNAP2Q9UHC6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNTNAP2Q9UHC6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNTNAP2Q9UHC6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CNTNAP2Q9UHC6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNTNAP2Q9UHC6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNTNAP2Q9UHC6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNTNAP2Q9UHC6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNTNAP2Q9UHC6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CNTNAP2Q9UHC6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNTNAP2Q9UHC6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNTNAP2Q9UHC6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNTNAP2Q9UHC6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNTNAP2Q9UHC6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNTNAP2Q9UHC6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNTNAP2Q9UHC6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNTNAP2Q9UHC6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNTNAP2Q9UHC6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNTNAP2Q9UHC6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNTNAP2Q9UHC6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNTNAP2Q9UHC6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNTNAP2Q9UHC6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNTNAP2Q9UHC6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNTNAP2Q9UHC6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CNTNAP2Q9UHC6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CNTNAP2Q9UHC6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CNTNAP2Q9UHC6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CNTNAP2Q9UHC6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNTNAP2Q9UHC6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNTNAP2Q9UHC6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNTNAP2Q9UHC6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNTNAP2Q9UHC6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNTNAP2Q9UHC6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNTNAP2Q9UHC6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNTNAP2Q9UHC6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNTNAP2Q9UHC6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNTNAP2Q9UHC6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNTNAP2Q9UHC6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNTNAP2Q9UHC6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNTNAP2Q9UHC6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNTNAP2Q9UHC6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNTNAP2Q9UHC6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNTNAP2Q9UHC6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNTNAP2Q9UHC6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNTNAP2Q9UHC6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNTNAP2Q9UHC6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CNTNAP2Q9UHC6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNTNAP2Q9UHC6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNTNAP2Q9UHC6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNTNAP2Q9UHC6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNTNAP2Q9UHC6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNTNAP2Q9UHC6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNTNAP2Q9UHC6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNTNAP2Q9UHC6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNTNAP2Q9UHC6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNTNAP2Q9UHC6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNTNAP2Q9UHC6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNTNAP2Q9UHC6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CNTNAP2Q9UHC6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNTNAP2Q9UHC6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNTNAP2Q9UHC6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNTNAP2Q9UHC6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CNTNAP2Q9UHC6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CNTNAP2Q9UHC6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CNTNAP2Q9UHC6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CNTNAP2Q9UHC6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CNTNAP2Q9UHC6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CNTNAP2Q9UHC6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CNTNAP2Q9UHC6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNTNAP2Q9UHC6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNTNAP2Q9UHC6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CNTNAP2Q9UHC6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNTNAP2Q9UHC6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNTNAP2Q9UHC6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNTNAP2Q9UHC6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNTNAP2Q9UHC6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNTNAP2Q9UHC6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNTNAP2Q9UHC6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNTNAP2Q9UHC6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTNAP2Q9UHC6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTNAP2Q9UHC6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNTNAP2Q9UHC6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNTNAP2Q9UHC6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNTNAP2Q9UHC6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CNTNAP2Q9UHC6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTNAP2Q9UHC6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTNAP2Q9UHC6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTNAP2Q9UHC6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTNAP2Q9UHC6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTNAP2Q9UHC6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTNAP2Q9UHC6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTNAP2Q9UHC6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTNAP2Q9UHC6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTNAP2Q9UHC6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTNAP2Q9UHC6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms