Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH77

KLHL3, Kelch-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL3Q9UH77 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL3Q9UH77 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL3Q9UH77 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL3Q9UH77 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL3Q9UH77 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL3Q9UH77 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL3Q9UH77 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHL3Q9UH77 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHL3Q9UH77 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHL3Q9UH77 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHL3Q9UH77 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL3Q9UH77 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL3Q9UH77 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL3Q9UH77 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL3Q9UH77 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL3Q9UH77 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL3Q9UH77 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL3Q9UH77 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL3Q9UH77 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL3Q9UH77 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL3Q9UH77 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KLHL3Q9UH77 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KLHL3Q9UH77 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL3Q9UH77 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL3Q9UH77 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL3Q9UH77 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL3Q9UH77 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL3Q9UH77 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL3Q9UH77 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL3Q9UH77 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL3Q9UH77 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL3Q9UH77 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL3Q9UH77 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL3Q9UH77 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL3Q9UH77 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL3Q9UH77 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL3Q9UH77 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL3Q9UH77 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL3Q9UH77 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL3Q9UH77 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL3Q9UH77 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL3Q9UH77 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL3Q9UH77 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL3Q9UH77 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL3Q9UH77 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL3Q9UH77 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL3Q9UH77 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL3Q9UH77 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL3Q9UH77 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KLHL3Q9UH77 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
KLHL3Q9UH77 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL3Q9UH77 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL3Q9UH77 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL3Q9UH77 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL3Q9UH77 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL3Q9UH77 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL3Q9UH77 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL3Q9UH77 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL3Q9UH77 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL3Q9UH77 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL3Q9UH77 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL3Q9UH77 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL3Q9UH77 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL3Q9UH77 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL3Q9UH77 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL3Q9UH77 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL3Q9UH77 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL3Q9UH77 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL3Q9UH77 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL3Q9UH77 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL3Q9UH77 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL3Q9UH77 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL3Q9UH77 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL3Q9UH77 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL3Q9UH77 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL3Q9UH77 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL3Q9UH77 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL3Q9UH77 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL3Q9UH77 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL3Q9UH77 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL3Q9UH77 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL3Q9UH77 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL3Q9UH77 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL3Q9UH77 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL3Q9UH77 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL3Q9UH77 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL3Q9UH77 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL3Q9UH77 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL3Q9UH77 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL3Q9UH77 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL3Q9UH77 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL3Q9UH77 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL3Q9UH77 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL3Q9UH77 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL3Q9UH77 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL3Q9UH77 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL3Q9UH77 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL3Q9UH77 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL3Q9UH77 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL3Q9UH77 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms