Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBJ2

ABCD2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD2Q9UBJ2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCD2Q9UBJ2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCD2Q9UBJ2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ABCD2Q9UBJ2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCD2Q9UBJ2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCD2Q9UBJ2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCD2Q9UBJ2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCD2Q9UBJ2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCD2Q9UBJ2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCD2Q9UBJ2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCD2Q9UBJ2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCD2Q9UBJ2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCD2Q9UBJ2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCD2Q9UBJ2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCD2Q9UBJ2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCD2Q9UBJ2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCD2Q9UBJ2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCD2Q9UBJ2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCD2Q9UBJ2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCD2Q9UBJ2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCD2Q9UBJ2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCD2Q9UBJ2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCD2Q9UBJ2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCD2Q9UBJ2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCD2Q9UBJ2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCD2Q9UBJ2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCD2Q9UBJ2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCD2Q9UBJ2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCD2Q9UBJ2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCD2Q9UBJ2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCD2Q9UBJ2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCD2Q9UBJ2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCD2Q9UBJ2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCD2Q9UBJ2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCD2Q9UBJ2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCD2Q9UBJ2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCD2Q9UBJ2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCD2Q9UBJ2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCD2Q9UBJ2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCD2Q9UBJ2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCD2Q9UBJ2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCD2Q9UBJ2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCD2Q9UBJ2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCD2Q9UBJ2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCD2Q9UBJ2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCD2Q9UBJ2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ABCD2Q9UBJ2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCD2Q9UBJ2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCD2Q9UBJ2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCD2Q9UBJ2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCD2Q9UBJ2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCD2Q9UBJ2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCD2Q9UBJ2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCD2Q9UBJ2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCD2Q9UBJ2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCD2Q9UBJ2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCD2Q9UBJ2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCD2Q9UBJ2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCD2Q9UBJ2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCD2Q9UBJ2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCD2Q9UBJ2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCD2Q9UBJ2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCD2Q9UBJ2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCD2Q9UBJ2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCD2Q9UBJ2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCD2Q9UBJ2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCD2Q9UBJ2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCD2Q9UBJ2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCD2Q9UBJ2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCD2Q9UBJ2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCD2Q9UBJ2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCD2Q9UBJ2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCD2Q9UBJ2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCD2Q9UBJ2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCD2Q9UBJ2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCD2Q9UBJ2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCD2Q9UBJ2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCD2Q9UBJ2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCD2Q9UBJ2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCD2Q9UBJ2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCD2Q9UBJ2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCD2Q9UBJ2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCD2Q9UBJ2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCD2Q9UBJ2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCD2Q9UBJ2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCD2Q9UBJ2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCD2Q9UBJ2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCD2Q9UBJ2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCD2Q9UBJ2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCD2Q9UBJ2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCD2Q9UBJ2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCD2Q9UBJ2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCD2Q9UBJ2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCD2Q9UBJ2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCD2Q9UBJ2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCD2Q9UBJ2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
ABCD2Q9UBJ2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCD2Q9UBJ2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCD2Q9UBJ2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCD2Q9UBJ2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms