Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCDH10Q9P2E7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCDH10Q9P2E7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCDH10Q9P2E7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PCDH10Q9P2E7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCDH10Q9P2E7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCDH10Q9P2E7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCDH10Q9P2E7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCDH10Q9P2E7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCDH10Q9P2E7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCDH10Q9P2E7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCDH10Q9P2E7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCDH10Q9P2E7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PCDH10Q9P2E7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PCDH10Q9P2E7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCDH10Q9P2E7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCDH10Q9P2E7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCDH10Q9P2E7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PCDH10Q9P2E7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PCDH10Q9P2E7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PCDH10Q9P2E7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PCDH10Q9P2E7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PCDH10Q9P2E7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PCDH10Q9P2E7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCDH10Q9P2E7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCDH10Q9P2E7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PCDH10Q9P2E7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PCDH10Q9P2E7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PCDH10Q9P2E7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PCDH10Q9P2E7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PCDH10Q9P2E7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PCDH10Q9P2E7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PCDH10Q9P2E7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PCDH10Q9P2E7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PCDH10Q9P2E7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PCDH10Q9P2E7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCDH10Q9P2E7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCDH10Q9P2E7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCDH10Q9P2E7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCDH10Q9P2E7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PCDH10Q9P2E7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PCDH10Q9P2E7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PCDH10Q9P2E7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PCDH10Q9P2E7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCDH10Q9P2E7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PCDH10Q9P2E7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PCDH10Q9P2E7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCDH10Q9P2E7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCDH10Q9P2E7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCDH10Q9P2E7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCDH10Q9P2E7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCDH10Q9P2E7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PCDH10Q9P2E7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCDH10Q9P2E7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCDH10Q9P2E7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCDH10Q9P2E7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCDH10Q9P2E7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCDH10Q9P2E7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCDH10Q9P2E7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PCDH10Q9P2E7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PCDH10Q9P2E7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PCDH10Q9P2E7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PCDH10Q9P2E7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PCDH10Q9P2E7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PCDH10Q9P2E7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PCDH10Q9P2E7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PCDH10Q9P2E7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PCDH10Q9P2E7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PCDH10Q9P2E7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PCDH10Q9P2E7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PCDH10Q9P2E7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PCDH10Q9P2E7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PCDH10Q9P2E7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PCDH10Q9P2E7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCDH10Q9P2E7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCDH10Q9P2E7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCDH10Q9P2E7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCDH10Q9P2E7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCDH10Q9P2E7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCDH10Q9P2E7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PCDH10Q9P2E7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PCDH10Q9P2E7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PCDH10Q9P2E7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
PCDH10Q9P2E7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PCDH10Q9P2E7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PCDH10Q9P2E7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PCDH10Q9P2E7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PCDH10Q9P2E7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PCDH10Q9P2E7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PCDH10Q9P2E7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PCDH10Q9P2E7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PCDH10Q9P2E7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PCDH10Q9P2E7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PCDH10Q9P2E7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PCDH10Q9P2E7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PCDH10Q9P2E7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PCDH10Q9P2E7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PCDH10Q9P2E7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PCDH10Q9P2E7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PCDH10Q9P2E7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms