Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRY4

ARHGAP35, Rho GTPase-activating protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP35Q9NRY4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC41.28■■■■■ 4.2
ARHGAP35Q9NRY4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
ARHGAP35Q9NRY4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
ARHGAP35Q9NRY4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC41.26■■■■■ 4.2
ARHGAP35Q9NRY4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC41.26■■■■■ 4.2
ARHGAP35Q9NRY4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC41.25■■■■■ 4.19
ARHGAP35Q9NRY4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
ARHGAP35Q9NRY4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
ARHGAP35Q9NRY4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
ARHGAP35Q9NRY4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC41.24■■■■■ 4.19
ARHGAP35Q9NRY4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
ARHGAP35Q9NRY4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC41.21■■■■■ 4.19
ARHGAP35Q9NRY4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
ARHGAP35Q9NRY4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
ARHGAP35Q9NRY4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
ARHGAP35Q9NRY4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
ARHGAP35Q9NRY4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
ARHGAP35Q9NRY4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
ARHGAP35Q9NRY4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
ARHGAP35Q9NRY4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
ARHGAP35Q9NRY4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC41.19■■■■■ 4.18
ARHGAP35Q9NRY4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC41.18■■■■■ 4.18
ARHGAP35Q9NRY4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
ARHGAP35Q9NRY4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
ARHGAP35Q9NRY4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
ARHGAP35Q9NRY4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
ARHGAP35Q9NRY4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
ARHGAP35Q9NRY4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC41.17■■■■■ 4.18
ARHGAP35Q9NRY4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
ARHGAP35Q9NRY4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
ARHGAP35Q9NRY4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
ARHGAP35Q9NRY4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
ARHGAP35Q9NRY4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
ARHGAP35Q9NRY4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
ARHGAP35Q9NRY4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
ARHGAP35Q9NRY4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
ARHGAP35Q9NRY4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
ARHGAP35Q9NRY4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
ARHGAP35Q9NRY4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
ARHGAP35Q9NRY4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC41.08■■■■■ 4.17
ARHGAP35Q9NRY4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC41.08■■■■■ 4.17
ARHGAP35Q9NRY4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC41.07■■■■■ 4.17
ARHGAP35Q9NRY4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
ARHGAP35Q9NRY4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.16
ARHGAP35Q9NRY4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
ARHGAP35Q9NRY4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
ARHGAP35Q9NRY4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
ARHGAP35Q9NRY4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC41.05■■■■■ 4.16
ARHGAP35Q9NRY4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
ARHGAP35Q9NRY4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
ARHGAP35Q9NRY4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
ARHGAP35Q9NRY4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
ARHGAP35Q9NRY4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
ARHGAP35Q9NRY4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC41.03■■■■■ 4.16
ARHGAP35Q9NRY4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
ARHGAP35Q9NRY4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.02■■■■■ 4.16
ARHGAP35Q9NRY4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
ARHGAP35Q9NRY4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
ARHGAP35Q9NRY4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
ARHGAP35Q9NRY4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC41.01■■■■■ 4.16
ARHGAP35Q9NRY4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.16
ARHGAP35Q9NRY4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.01■■■■■ 4.16
ARHGAP35Q9NRY4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.15
ARHGAP35Q9NRY4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
ARHGAP35Q9NRY4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
ARHGAP35Q9NRY4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
ARHGAP35Q9NRY4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
ARHGAP35Q9NRY4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
ARHGAP35Q9NRY4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC40.98■■■■■ 4.15
ARHGAP35Q9NRY4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
ARHGAP35Q9NRY4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
ARHGAP35Q9NRY4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
ARHGAP35Q9NRY4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
ARHGAP35Q9NRY4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
ARHGAP35Q9NRY4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
ARHGAP35Q9NRY4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.14
ARHGAP35Q9NRY4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.14
ARHGAP35Q9NRY4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
ARHGAP35Q9NRY4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
ARHGAP35Q9NRY4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
ARHGAP35Q9NRY4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
ARHGAP35Q9NRY4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
ARHGAP35Q9NRY4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
ARHGAP35Q9NRY4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
ARHGAP35Q9NRY4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
ARHGAP35Q9NRY4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC40.91■■■■■ 4.14
ARHGAP35Q9NRY4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
ARHGAP35Q9NRY4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
ARHGAP35Q9NRY4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
ARHGAP35Q9NRY4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
ARHGAP35Q9NRY4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC40.9■■■■■ 4.14
ARHGAP35Q9NRY4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC40.9■■■■■ 4.14
ARHGAP35Q9NRY4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
ARHGAP35Q9NRY4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
ARHGAP35Q9NRY4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC40.89■■■■■ 4.14
ARHGAP35Q9NRY4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
ARHGAP35Q9NRY4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
ARHGAP35Q9NRY4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
ARHGAP35Q9NRY4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.88■■■■■ 4.13
ARHGAP35Q9NRY4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms