Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMPRSS4Q9NRS4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMPRSS4Q9NRS4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMPRSS4Q9NRS4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMPRSS4Q9NRS4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMPRSS4Q9NRS4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMPRSS4Q9NRS4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TMPRSS4Q9NRS4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMPRSS4Q9NRS4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMPRSS4Q9NRS4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMPRSS4Q9NRS4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMPRSS4Q9NRS4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMPRSS4Q9NRS4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMPRSS4Q9NRS4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMPRSS4Q9NRS4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMPRSS4Q9NRS4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TMPRSS4Q9NRS4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMPRSS4Q9NRS4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMPRSS4Q9NRS4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMPRSS4Q9NRS4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMPRSS4Q9NRS4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TMPRSS4Q9NRS4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMPRSS4Q9NRS4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMPRSS4Q9NRS4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMPRSS4Q9NRS4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMPRSS4Q9NRS4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMPRSS4Q9NRS4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMPRSS4Q9NRS4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TMPRSS4Q9NRS4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMPRSS4Q9NRS4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMPRSS4Q9NRS4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMPRSS4Q9NRS4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMPRSS4Q9NRS4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMPRSS4Q9NRS4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMPRSS4Q9NRS4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMPRSS4Q9NRS4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMPRSS4Q9NRS4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMPRSS4Q9NRS4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TMPRSS4Q9NRS4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMPRSS4Q9NRS4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMPRSS4Q9NRS4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMPRSS4Q9NRS4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMPRSS4Q9NRS4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMPRSS4Q9NRS4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMPRSS4Q9NRS4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMPRSS4Q9NRS4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMPRSS4Q9NRS4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMPRSS4Q9NRS4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMPRSS4Q9NRS4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMPRSS4Q9NRS4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMPRSS4Q9NRS4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMPRSS4Q9NRS4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMPRSS4Q9NRS4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMPRSS4Q9NRS4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMPRSS4Q9NRS4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMPRSS4Q9NRS4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMPRSS4Q9NRS4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMPRSS4Q9NRS4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMPRSS4Q9NRS4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TMPRSS4Q9NRS4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TMPRSS4Q9NRS4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMPRSS4Q9NRS4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMPRSS4Q9NRS4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMPRSS4Q9NRS4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMPRSS4Q9NRS4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMPRSS4Q9NRS4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TMPRSS4Q9NRS4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMPRSS4Q9NRS4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMPRSS4Q9NRS4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMPRSS4Q9NRS4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TMPRSS4Q9NRS4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMPRSS4Q9NRS4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMPRSS4Q9NRS4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMPRSS4Q9NRS4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMPRSS4Q9NRS4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMPRSS4Q9NRS4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMPRSS4Q9NRS4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TMPRSS4Q9NRS4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TMPRSS4Q9NRS4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TMPRSS4Q9NRS4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMPRSS4Q9NRS4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMPRSS4Q9NRS4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMPRSS4Q9NRS4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMPRSS4Q9NRS4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMPRSS4Q9NRS4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMPRSS4Q9NRS4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMPRSS4Q9NRS4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMPRSS4Q9NRS4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMPRSS4Q9NRS4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMPRSS4Q9NRS4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMPRSS4Q9NRS4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMPRSS4Q9NRS4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMPRSS4Q9NRS4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMPRSS4Q9NRS4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMPRSS4Q9NRS4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMPRSS4Q9NRS4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMPRSS4Q9NRS4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMPRSS4Q9NRS4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms