Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV8

PRDM8, PR domain zinc finger protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8Q9NQV8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM8Q9NQV8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM8Q9NQV8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM8Q9NQV8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM8Q9NQV8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM8Q9NQV8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM8Q9NQV8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM8Q9NQV8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM8Q9NQV8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM8Q9NQV8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM8Q9NQV8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM8Q9NQV8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PRDM8Q9NQV8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRDM8Q9NQV8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRDM8Q9NQV8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRDM8Q9NQV8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRDM8Q9NQV8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRDM8Q9NQV8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM8Q9NQV8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM8Q9NQV8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM8Q9NQV8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM8Q9NQV8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRDM8Q9NQV8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRDM8Q9NQV8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRDM8Q9NQV8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRDM8Q9NQV8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRDM8Q9NQV8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRDM8Q9NQV8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRDM8Q9NQV8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRDM8Q9NQV8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM8Q9NQV8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM8Q9NQV8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM8Q9NQV8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM8Q9NQV8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM8Q9NQV8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM8Q9NQV8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM8Q9NQV8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM8Q9NQV8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRDM8Q9NQV8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRDM8Q9NQV8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRDM8Q9NQV8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRDM8Q9NQV8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRDM8Q9NQV8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRDM8Q9NQV8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRDM8Q9NQV8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM8Q9NQV8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM8Q9NQV8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM8Q9NQV8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM8Q9NQV8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM8Q9NQV8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM8Q9NQV8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM8Q9NQV8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM8Q9NQV8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM8Q9NQV8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM8Q9NQV8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM8Q9NQV8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM8Q9NQV8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM8Q9NQV8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM8Q9NQV8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM8Q9NQV8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM8Q9NQV8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM8Q9NQV8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM8Q9NQV8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM8Q9NQV8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM8Q9NQV8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM8Q9NQV8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRDM8Q9NQV8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM8Q9NQV8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM8Q9NQV8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM8Q9NQV8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM8Q9NQV8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM8Q9NQV8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM8Q9NQV8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM8Q9NQV8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM8Q9NQV8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM8Q9NQV8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM8Q9NQV8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM8Q9NQV8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM8Q9NQV8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM8Q9NQV8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM8Q9NQV8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM8Q9NQV8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM8Q9NQV8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM8Q9NQV8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM8Q9NQV8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM8Q9NQV8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM8Q9NQV8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM8Q9NQV8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM8Q9NQV8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM8Q9NQV8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM8Q9NQV8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PRDM8Q9NQV8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRDM8Q9NQV8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRDM8Q9NQV8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRDM8Q9NQV8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRDM8Q9NQV8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM8Q9NQV8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM8Q9NQV8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRDM8Q9NQV8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PRDM8Q9NQV8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.9 ms