Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LHX9Q9NQ69 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LHX9Q9NQ69 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LHX9Q9NQ69 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LHX9Q9NQ69 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LHX9Q9NQ69 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LHX9Q9NQ69 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LHX9Q9NQ69 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LHX9Q9NQ69 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LHX9Q9NQ69 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LHX9Q9NQ69 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LHX9Q9NQ69 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LHX9Q9NQ69 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LHX9Q9NQ69 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LHX9Q9NQ69 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LHX9Q9NQ69 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LHX9Q9NQ69 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LHX9Q9NQ69 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LHX9Q9NQ69 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LHX9Q9NQ69 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LHX9Q9NQ69 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LHX9Q9NQ69 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LHX9Q9NQ69 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LHX9Q9NQ69 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LHX9Q9NQ69 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LHX9Q9NQ69 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LHX9Q9NQ69 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LHX9Q9NQ69 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LHX9Q9NQ69 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LHX9Q9NQ69 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LHX9Q9NQ69 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LHX9Q9NQ69 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LHX9Q9NQ69 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LHX9Q9NQ69 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LHX9Q9NQ69 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LHX9Q9NQ69 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LHX9Q9NQ69 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LHX9Q9NQ69 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LHX9Q9NQ69 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LHX9Q9NQ69 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LHX9Q9NQ69 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LHX9Q9NQ69 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LHX9Q9NQ69 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LHX9Q9NQ69 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LHX9Q9NQ69 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LHX9Q9NQ69 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LHX9Q9NQ69 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LHX9Q9NQ69 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LHX9Q9NQ69 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LHX9Q9NQ69 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LHX9Q9NQ69 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LHX9Q9NQ69 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LHX9Q9NQ69 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LHX9Q9NQ69 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LHX9Q9NQ69 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LHX9Q9NQ69 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LHX9Q9NQ69 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LHX9Q9NQ69 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LHX9Q9NQ69 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LHX9Q9NQ69 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LHX9Q9NQ69 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LHX9Q9NQ69 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LHX9Q9NQ69 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LHX9Q9NQ69 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LHX9Q9NQ69 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LHX9Q9NQ69 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LHX9Q9NQ69 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LHX9Q9NQ69 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LHX9Q9NQ69 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LHX9Q9NQ69 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LHX9Q9NQ69 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LHX9Q9NQ69 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LHX9Q9NQ69 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LHX9Q9NQ69 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LHX9Q9NQ69 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LHX9Q9NQ69 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
LHX9Q9NQ69 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LHX9Q9NQ69 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LHX9Q9NQ69 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LHX9Q9NQ69 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LHX9Q9NQ69 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LHX9Q9NQ69 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LHX9Q9NQ69 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LHX9Q9NQ69 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LHX9Q9NQ69 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LHX9Q9NQ69 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LHX9Q9NQ69 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LHX9Q9NQ69 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LHX9Q9NQ69 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LHX9Q9NQ69 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LHX9Q9NQ69 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LHX9Q9NQ69 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LHX9Q9NQ69 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LHX9Q9NQ69 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LHX9Q9NQ69 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LHX9Q9NQ69 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LHX9Q9NQ69 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LHX9Q9NQ69 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LHX9Q9NQ69 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LHX9Q9NQ69 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms