Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TIMMDC1Q9NPL8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TIMMDC1Q9NPL8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TIMMDC1Q9NPL8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TIMMDC1Q9NPL8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TIMMDC1Q9NPL8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TIMMDC1Q9NPL8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TIMMDC1Q9NPL8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TIMMDC1Q9NPL8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TIMMDC1Q9NPL8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TIMMDC1Q9NPL8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TIMMDC1Q9NPL8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TIMMDC1Q9NPL8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TIMMDC1Q9NPL8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TIMMDC1Q9NPL8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TIMMDC1Q9NPL8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TIMMDC1Q9NPL8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TIMMDC1Q9NPL8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TIMMDC1Q9NPL8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TIMMDC1Q9NPL8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TIMMDC1Q9NPL8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TIMMDC1Q9NPL8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TIMMDC1Q9NPL8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TIMMDC1Q9NPL8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TIMMDC1Q9NPL8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TIMMDC1Q9NPL8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TIMMDC1Q9NPL8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TIMMDC1Q9NPL8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TIMMDC1Q9NPL8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TIMMDC1Q9NPL8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TIMMDC1Q9NPL8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TIMMDC1Q9NPL8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TIMMDC1Q9NPL8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TIMMDC1Q9NPL8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TIMMDC1Q9NPL8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TIMMDC1Q9NPL8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TIMMDC1Q9NPL8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TIMMDC1Q9NPL8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TIMMDC1Q9NPL8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TIMMDC1Q9NPL8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TIMMDC1Q9NPL8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TIMMDC1Q9NPL8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TIMMDC1Q9NPL8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TIMMDC1Q9NPL8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TIMMDC1Q9NPL8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TIMMDC1Q9NPL8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TIMMDC1Q9NPL8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TIMMDC1Q9NPL8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TIMMDC1Q9NPL8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TIMMDC1Q9NPL8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TIMMDC1Q9NPL8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TIMMDC1Q9NPL8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TIMMDC1Q9NPL8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TIMMDC1Q9NPL8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TIMMDC1Q9NPL8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TIMMDC1Q9NPL8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TIMMDC1Q9NPL8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TIMMDC1Q9NPL8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TIMMDC1Q9NPL8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TIMMDC1Q9NPL8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TIMMDC1Q9NPL8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TIMMDC1Q9NPL8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TIMMDC1Q9NPL8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TIMMDC1Q9NPL8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TIMMDC1Q9NPL8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TIMMDC1Q9NPL8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TIMMDC1Q9NPL8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TIMMDC1Q9NPL8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TIMMDC1Q9NPL8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TIMMDC1Q9NPL8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TIMMDC1Q9NPL8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TIMMDC1Q9NPL8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIMMDC1Q9NPL8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIMMDC1Q9NPL8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIMMDC1Q9NPL8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIMMDC1Q9NPL8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIMMDC1Q9NPL8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIMMDC1Q9NPL8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIMMDC1Q9NPL8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIMMDC1Q9NPL8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIMMDC1Q9NPL8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIMMDC1Q9NPL8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIMMDC1Q9NPL8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIMMDC1Q9NPL8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIMMDC1Q9NPL8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIMMDC1Q9NPL8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIMMDC1Q9NPL8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIMMDC1Q9NPL8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TIMMDC1Q9NPL8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TIMMDC1Q9NPL8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TIMMDC1Q9NPL8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms