Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Y6

POLR1B, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1BQ9H9Y6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR1BQ9H9Y6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR1BQ9H9Y6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR1BQ9H9Y6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR1BQ9H9Y6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR1BQ9H9Y6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR1BQ9H9Y6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR1BQ9H9Y6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLR1BQ9H9Y6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR1BQ9H9Y6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR1BQ9H9Y6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR1BQ9H9Y6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR1BQ9H9Y6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR1BQ9H9Y6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR1BQ9H9Y6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR1BQ9H9Y6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR1BQ9H9Y6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR1BQ9H9Y6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR1BQ9H9Y6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR1BQ9H9Y6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR1BQ9H9Y6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR1BQ9H9Y6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR1BQ9H9Y6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR1BQ9H9Y6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR1BQ9H9Y6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR1BQ9H9Y6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR1BQ9H9Y6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
POLR1BQ9H9Y6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR1BQ9H9Y6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR1BQ9H9Y6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR1BQ9H9Y6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR1BQ9H9Y6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR1BQ9H9Y6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR1BQ9H9Y6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR1BQ9H9Y6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR1BQ9H9Y6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR1BQ9H9Y6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR1BQ9H9Y6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR1BQ9H9Y6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR1BQ9H9Y6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR1BQ9H9Y6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR1BQ9H9Y6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR1BQ9H9Y6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR1BQ9H9Y6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR1BQ9H9Y6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR1BQ9H9Y6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR1BQ9H9Y6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR1BQ9H9Y6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR1BQ9H9Y6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR1BQ9H9Y6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR1BQ9H9Y6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR1BQ9H9Y6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR1BQ9H9Y6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR1BQ9H9Y6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR1BQ9H9Y6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR1BQ9H9Y6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR1BQ9H9Y6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR1BQ9H9Y6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR1BQ9H9Y6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR1BQ9H9Y6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR1BQ9H9Y6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR1BQ9H9Y6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR1BQ9H9Y6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR1BQ9H9Y6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR1BQ9H9Y6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR1BQ9H9Y6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR1BQ9H9Y6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR1BQ9H9Y6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR1BQ9H9Y6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR1BQ9H9Y6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR1BQ9H9Y6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR1BQ9H9Y6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR1BQ9H9Y6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR1BQ9H9Y6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR1BQ9H9Y6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR1BQ9H9Y6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR1BQ9H9Y6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR1BQ9H9Y6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR1BQ9H9Y6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR1BQ9H9Y6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR1BQ9H9Y6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR1BQ9H9Y6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR1BQ9H9Y6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR1BQ9H9Y6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR1BQ9H9Y6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR1BQ9H9Y6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR1BQ9H9Y6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR1BQ9H9Y6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR1BQ9H9Y6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR1BQ9H9Y6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR1BQ9H9Y6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR1BQ9H9Y6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR1BQ9H9Y6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR1BQ9H9Y6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR1BQ9H9Y6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR1BQ9H9Y6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR1BQ9H9Y6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR1BQ9H9Y6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR1BQ9H9Y6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR1BQ9H9Y6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms