Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0U4

RAB1B, Ras-related protein Rab-1B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1BQ9H0U4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB1BQ9H0U4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB1BQ9H0U4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB1BQ9H0U4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB1BQ9H0U4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB1BQ9H0U4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB1BQ9H0U4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB1BQ9H0U4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB1BQ9H0U4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB1BQ9H0U4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB1BQ9H0U4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB1BQ9H0U4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB1BQ9H0U4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB1BQ9H0U4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB1BQ9H0U4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB1BQ9H0U4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB1BQ9H0U4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB1BQ9H0U4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB1BQ9H0U4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB1BQ9H0U4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB1BQ9H0U4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB1BQ9H0U4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB1BQ9H0U4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB1BQ9H0U4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB1BQ9H0U4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB1BQ9H0U4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RAB1BQ9H0U4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB1BQ9H0U4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB1BQ9H0U4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB1BQ9H0U4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB1BQ9H0U4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB1BQ9H0U4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB1BQ9H0U4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB1BQ9H0U4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB1BQ9H0U4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB1BQ9H0U4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB1BQ9H0U4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB1BQ9H0U4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB1BQ9H0U4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB1BQ9H0U4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB1BQ9H0U4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB1BQ9H0U4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB1BQ9H0U4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB1BQ9H0U4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB1BQ9H0U4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB1BQ9H0U4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB1BQ9H0U4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB1BQ9H0U4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB1BQ9H0U4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB1BQ9H0U4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB1BQ9H0U4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB1BQ9H0U4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB1BQ9H0U4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB1BQ9H0U4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB1BQ9H0U4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB1BQ9H0U4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB1BQ9H0U4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB1BQ9H0U4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB1BQ9H0U4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB1BQ9H0U4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB1BQ9H0U4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB1BQ9H0U4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB1BQ9H0U4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB1BQ9H0U4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB1BQ9H0U4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB1BQ9H0U4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB1BQ9H0U4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB1BQ9H0U4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB1BQ9H0U4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB1BQ9H0U4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB1BQ9H0U4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB1BQ9H0U4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB1BQ9H0U4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB1BQ9H0U4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB1BQ9H0U4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB1BQ9H0U4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB1BQ9H0U4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB1BQ9H0U4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB1BQ9H0U4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB1BQ9H0U4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB1BQ9H0U4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB1BQ9H0U4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB1BQ9H0U4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB1BQ9H0U4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB1BQ9H0U4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB1BQ9H0U4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB1BQ9H0U4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB1BQ9H0U4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAB1BQ9H0U4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB1BQ9H0U4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB1BQ9H0U4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB1BQ9H0U4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB1BQ9H0U4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB1BQ9H0U4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB1BQ9H0U4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB1BQ9H0U4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB1BQ9H0U4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB1BQ9H0U4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB1BQ9H0U4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB1BQ9H0U4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms