Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0G0

ZNF407, Zinc finger protein 407, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF407Q9C0G0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF407Q9C0G0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF407Q9C0G0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF407Q9C0G0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF407Q9C0G0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF407Q9C0G0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF407Q9C0G0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF407Q9C0G0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF407Q9C0G0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF407Q9C0G0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF407Q9C0G0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF407Q9C0G0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF407Q9C0G0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF407Q9C0G0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF407Q9C0G0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF407Q9C0G0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF407Q9C0G0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF407Q9C0G0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF407Q9C0G0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF407Q9C0G0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
ZNF407Q9C0G0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF407Q9C0G0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF407Q9C0G0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF407Q9C0G0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF407Q9C0G0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF407Q9C0G0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF407Q9C0G0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF407Q9C0G0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF407Q9C0G0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF407Q9C0G0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF407Q9C0G0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF407Q9C0G0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF407Q9C0G0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF407Q9C0G0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF407Q9C0G0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF407Q9C0G0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF407Q9C0G0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF407Q9C0G0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF407Q9C0G0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF407Q9C0G0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF407Q9C0G0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF407Q9C0G0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF407Q9C0G0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF407Q9C0G0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF407Q9C0G0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF407Q9C0G0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF407Q9C0G0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF407Q9C0G0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF407Q9C0G0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF407Q9C0G0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF407Q9C0G0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF407Q9C0G0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF407Q9C0G0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF407Q9C0G0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF407Q9C0G0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF407Q9C0G0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF407Q9C0G0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF407Q9C0G0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF407Q9C0G0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF407Q9C0G0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF407Q9C0G0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF407Q9C0G0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF407Q9C0G0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF407Q9C0G0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF407Q9C0G0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF407Q9C0G0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF407Q9C0G0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF407Q9C0G0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF407Q9C0G0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF407Q9C0G0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF407Q9C0G0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF407Q9C0G0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF407Q9C0G0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF407Q9C0G0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF407Q9C0G0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF407Q9C0G0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF407Q9C0G0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF407Q9C0G0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF407Q9C0G0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF407Q9C0G0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF407Q9C0G0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF407Q9C0G0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF407Q9C0G0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF407Q9C0G0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF407Q9C0G0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF407Q9C0G0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF407Q9C0G0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF407Q9C0G0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF407Q9C0G0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF407Q9C0G0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF407Q9C0G0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF407Q9C0G0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF407Q9C0G0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF407Q9C0G0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF407Q9C0G0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF407Q9C0G0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF407Q9C0G0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF407Q9C0G0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF407Q9C0G0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF407Q9C0G0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms