Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
PCGF6Q9BYE7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
PCGF6Q9BYE7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
PCGF6Q9BYE7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
PCGF6Q9BYE7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
PCGF6Q9BYE7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
PCGF6Q9BYE7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
PCGF6Q9BYE7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
PCGF6Q9BYE7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
PCGF6Q9BYE7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
PCGF6Q9BYE7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
PCGF6Q9BYE7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
PCGF6Q9BYE7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC39.69■■■■□ 3.94
PCGF6Q9BYE7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
PCGF6Q9BYE7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
PCGF6Q9BYE7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC39.67■■■■□ 3.94
PCGF6Q9BYE7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC39.66■■■■□ 3.94
PCGF6Q9BYE7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
PCGF6Q9BYE7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC39.66■■■■□ 3.94
PCGF6Q9BYE7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC39.66■■■■□ 3.94
PCGF6Q9BYE7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
PCGF6Q9BYE7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
PCGF6Q9BYE7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
PCGF6Q9BYE7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
PCGF6Q9BYE7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
PCGF6Q9BYE7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.94
PCGF6Q9BYE7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC39.63■■■■□ 3.94
PCGF6Q9BYE7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
PCGF6Q9BYE7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
PCGF6Q9BYE7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
PCGF6Q9BYE7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
PCGF6Q9BYE7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
PCGF6Q9BYE7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
PCGF6Q9BYE7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC39.59■■■■□ 3.93
PCGF6Q9BYE7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
PCGF6Q9BYE7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC39.59■■■■□ 3.93
PCGF6Q9BYE7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC39.59■■■■□ 3.93
PCGF6Q9BYE7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
PCGF6Q9BYE7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
PCGF6Q9BYE7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC39.57■■■■□ 3.93
PCGF6Q9BYE7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.92
PCGF6Q9BYE7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
PCGF6Q9BYE7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
PCGF6Q9BYE7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
PCGF6Q9BYE7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC39.55■■■■□ 3.92
PCGF6Q9BYE7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
PCGF6Q9BYE7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
PCGF6Q9BYE7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
PCGF6Q9BYE7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC39.52■■■■□ 3.92
PCGF6Q9BYE7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
PCGF6Q9BYE7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
PCGF6Q9BYE7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC39.5■■■■□ 3.91
PCGF6Q9BYE7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
PCGF6Q9BYE7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
PCGF6Q9BYE7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
PCGF6Q9BYE7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
PCGF6Q9BYE7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
PCGF6Q9BYE7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
PCGF6Q9BYE7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
PCGF6Q9BYE7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.45■■■■□ 3.91
PCGF6Q9BYE7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
PCGF6Q9BYE7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
PCGF6Q9BYE7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
PCGF6Q9BYE7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
PCGF6Q9BYE7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
PCGF6Q9BYE7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
PCGF6Q9BYE7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
PCGF6Q9BYE7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
PCGF6Q9BYE7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.42■■■■□ 3.9
PCGF6Q9BYE7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
PCGF6Q9BYE7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
PCGF6Q9BYE7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
PCGF6Q9BYE7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
PCGF6Q9BYE7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC39.41■■■■□ 3.9
PCGF6Q9BYE7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
PCGF6Q9BYE7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
PCGF6Q9BYE7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
PCGF6Q9BYE7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
PCGF6Q9BYE7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
PCGF6Q9BYE7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
PCGF6Q9BYE7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC39.39■■■■□ 3.9
PCGF6Q9BYE7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
PCGF6Q9BYE7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
PCGF6Q9BYE7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC39.39■■■■□ 3.9
PCGF6Q9BYE7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
PCGF6Q9BYE7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
PCGF6Q9BYE7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
PCGF6Q9BYE7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.89
PCGF6Q9BYE7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
PCGF6Q9BYE7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
PCGF6Q9BYE7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
PCGF6Q9BYE7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
PCGF6Q9BYE7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
PCGF6Q9BYE7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
PCGF6Q9BYE7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
PCGF6Q9BYE7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
PCGF6Q9BYE7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
PCGF6Q9BYE7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
PCGF6Q9BYE7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
PCGF6Q9BYE7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms