Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW27

NUP85, Nuclear pore complex protein Nup85, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP85Q9BW27 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUP85Q9BW27 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUP85Q9BW27 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NUP85Q9BW27 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUP85Q9BW27 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP85Q9BW27 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP85Q9BW27 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP85Q9BW27 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP85Q9BW27 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUP85Q9BW27 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP85Q9BW27 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP85Q9BW27 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP85Q9BW27 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP85Q9BW27 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP85Q9BW27 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP85Q9BW27 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP85Q9BW27 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
NUP85Q9BW27 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP85Q9BW27 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP85Q9BW27 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP85Q9BW27 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP85Q9BW27 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP85Q9BW27 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP85Q9BW27 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP85Q9BW27 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP85Q9BW27 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP85Q9BW27 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP85Q9BW27 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP85Q9BW27 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP85Q9BW27 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP85Q9BW27 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP85Q9BW27 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP85Q9BW27 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP85Q9BW27 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP85Q9BW27 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP85Q9BW27 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP85Q9BW27 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP85Q9BW27 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUP85Q9BW27 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUP85Q9BW27 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NUP85Q9BW27 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NUP85Q9BW27 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NUP85Q9BW27 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NUP85Q9BW27 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NUP85Q9BW27 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP85Q9BW27 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP85Q9BW27 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP85Q9BW27 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP85Q9BW27 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP85Q9BW27 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP85Q9BW27 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP85Q9BW27 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP85Q9BW27 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP85Q9BW27 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP85Q9BW27 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP85Q9BW27 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP85Q9BW27 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP85Q9BW27 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP85Q9BW27 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NUP85Q9BW27 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NUP85Q9BW27 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NUP85Q9BW27 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NUP85Q9BW27 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NUP85Q9BW27 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP85Q9BW27 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP85Q9BW27 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP85Q9BW27 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP85Q9BW27 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP85Q9BW27 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP85Q9BW27 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP85Q9BW27 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP85Q9BW27 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP85Q9BW27 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP85Q9BW27 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NUP85Q9BW27 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NUP85Q9BW27 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUP85Q9BW27 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUP85Q9BW27 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUP85Q9BW27 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP85Q9BW27 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP85Q9BW27 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP85Q9BW27 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP85Q9BW27 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP85Q9BW27 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NUP85Q9BW27 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NUP85Q9BW27 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NUP85Q9BW27 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP85Q9BW27 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP85Q9BW27 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP85Q9BW27 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP85Q9BW27 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP85Q9BW27 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP85Q9BW27 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP85Q9BW27 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP85Q9BW27 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP85Q9BW27 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP85Q9BW27 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP85Q9BW27 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP85Q9BW27 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP85Q9BW27 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms