Protein–RNA interactions for Protein: Q99728

BARD1, BRCA1-associated RING domain protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARD1Q99728 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BARD1Q99728 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BARD1Q99728 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BARD1Q99728 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BARD1Q99728 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BARD1Q99728 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BARD1Q99728 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BARD1Q99728 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BARD1Q99728 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BARD1Q99728 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BARD1Q99728 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BARD1Q99728 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BARD1Q99728 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BARD1Q99728 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BARD1Q99728 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BARD1Q99728 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BARD1Q99728 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BARD1Q99728 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BARD1Q99728 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BARD1Q99728 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BARD1Q99728 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BARD1Q99728 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BARD1Q99728 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BARD1Q99728 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BARD1Q99728 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BARD1Q99728 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BARD1Q99728 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BARD1Q99728 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BARD1Q99728 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BARD1Q99728 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BARD1Q99728 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BARD1Q99728 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BARD1Q99728 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BARD1Q99728 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BARD1Q99728 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BARD1Q99728 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BARD1Q99728 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BARD1Q99728 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BARD1Q99728 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BARD1Q99728 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BARD1Q99728 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BARD1Q99728 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BARD1Q99728 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BARD1Q99728 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BARD1Q99728 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BARD1Q99728 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BARD1Q99728 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BARD1Q99728 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BARD1Q99728 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BARD1Q99728 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BARD1Q99728 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BARD1Q99728 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BARD1Q99728 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BARD1Q99728 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BARD1Q99728 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BARD1Q99728 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BARD1Q99728 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BARD1Q99728 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BARD1Q99728 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BARD1Q99728 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BARD1Q99728 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BARD1Q99728 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BARD1Q99728 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BARD1Q99728 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BARD1Q99728 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BARD1Q99728 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BARD1Q99728 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BARD1Q99728 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BARD1Q99728 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BARD1Q99728 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BARD1Q99728 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BARD1Q99728 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BARD1Q99728 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BARD1Q99728 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BARD1Q99728 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BARD1Q99728 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BARD1Q99728 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BARD1Q99728 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BARD1Q99728 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BARD1Q99728 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BARD1Q99728 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BARD1Q99728 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BARD1Q99728 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BARD1Q99728 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BARD1Q99728 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BARD1Q99728 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BARD1Q99728 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BARD1Q99728 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BARD1Q99728 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BARD1Q99728 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BARD1Q99728 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BARD1Q99728 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BARD1Q99728 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BARD1Q99728 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BARD1Q99728 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BARD1Q99728 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BARD1Q99728 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BARD1Q99728 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BARD1Q99728 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BARD1Q99728 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms