Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LGMNQ99538 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LGMNQ99538 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LGMNQ99538 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LGMNQ99538 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LGMNQ99538 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LGMNQ99538 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LGMNQ99538 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LGMNQ99538 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LGMNQ99538 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LGMNQ99538 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LGMNQ99538 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LGMNQ99538 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LGMNQ99538 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LGMNQ99538 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LGMNQ99538 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LGMNQ99538 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LGMNQ99538 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LGMNQ99538 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LGMNQ99538 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
LGMNQ99538 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LGMNQ99538 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LGMNQ99538 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LGMNQ99538 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LGMNQ99538 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LGMNQ99538 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LGMNQ99538 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LGMNQ99538 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LGMNQ99538 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LGMNQ99538 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LGMNQ99538 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
LGMNQ99538 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LGMNQ99538 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LGMNQ99538 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LGMNQ99538 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LGMNQ99538 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LGMNQ99538 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LGMNQ99538 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LGMNQ99538 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LGMNQ99538 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LGMNQ99538 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LGMNQ99538 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LGMNQ99538 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LGMNQ99538 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LGMNQ99538 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
LGMNQ99538 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LGMNQ99538 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LGMNQ99538 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LGMNQ99538 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LGMNQ99538 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LGMNQ99538 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LGMNQ99538 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LGMNQ99538 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LGMNQ99538 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LGMNQ99538 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LGMNQ99538 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LGMNQ99538 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LGMNQ99538 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LGMNQ99538 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LGMNQ99538 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LGMNQ99538 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LGMNQ99538 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LGMNQ99538 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LGMNQ99538 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LGMNQ99538 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LGMNQ99538 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LGMNQ99538 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LGMNQ99538 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LGMNQ99538 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LGMNQ99538 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LGMNQ99538 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LGMNQ99538 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LGMNQ99538 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LGMNQ99538 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LGMNQ99538 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LGMNQ99538 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LGMNQ99538 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LGMNQ99538 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LGMNQ99538 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LGMNQ99538 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LGMNQ99538 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
LGMNQ99538 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
LGMNQ99538 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LGMNQ99538 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LGMNQ99538 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LGMNQ99538 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LGMNQ99538 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LGMNQ99538 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LGMNQ99538 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LGMNQ99538 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LGMNQ99538 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LGMNQ99538 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LGMNQ99538 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
LGMNQ99538 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LGMNQ99538 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LGMNQ99538 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LGMNQ99538 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LGMNQ99538 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
LGMNQ99538 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LGMNQ99538 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms