Protein–RNA interactions for Protein: Q96T76

MMS19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMS19Q96T76 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MMS19Q96T76 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MMS19Q96T76 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MMS19Q96T76 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MMS19Q96T76 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MMS19Q96T76 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MMS19Q96T76 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MMS19Q96T76 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MMS19Q96T76 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MMS19Q96T76 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MMS19Q96T76 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MMS19Q96T76 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MMS19Q96T76 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MMS19Q96T76 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MMS19Q96T76 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MMS19Q96T76 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MMS19Q96T76 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MMS19Q96T76 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MMS19Q96T76 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MMS19Q96T76 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MMS19Q96T76 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
MMS19Q96T76 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MMS19Q96T76 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
MMS19Q96T76 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MMS19Q96T76 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MMS19Q96T76 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MMS19Q96T76 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MMS19Q96T76 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MMS19Q96T76 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MMS19Q96T76 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MMS19Q96T76 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MMS19Q96T76 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MMS19Q96T76 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MMS19Q96T76 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MMS19Q96T76 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MMS19Q96T76 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MMS19Q96T76 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MMS19Q96T76 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MMS19Q96T76 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MMS19Q96T76 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MMS19Q96T76 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MMS19Q96T76 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MMS19Q96T76 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MMS19Q96T76 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MMS19Q96T76 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MMS19Q96T76 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MMS19Q96T76 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
MMS19Q96T76 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MMS19Q96T76 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MMS19Q96T76 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
MMS19Q96T76 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MMS19Q96T76 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MMS19Q96T76 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MMS19Q96T76 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MMS19Q96T76 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MMS19Q96T76 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MMS19Q96T76 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MMS19Q96T76 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
MMS19Q96T76 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MMS19Q96T76 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MMS19Q96T76 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MMS19Q96T76 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MMS19Q96T76 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MMS19Q96T76 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MMS19Q96T76 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MMS19Q96T76 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MMS19Q96T76 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MMS19Q96T76 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MMS19Q96T76 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MMS19Q96T76 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MMS19Q96T76 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MMS19Q96T76 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MMS19Q96T76 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MMS19Q96T76 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MMS19Q96T76 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MMS19Q96T76 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MMS19Q96T76 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MMS19Q96T76 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
MMS19Q96T76 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MMS19Q96T76 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MMS19Q96T76 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MMS19Q96T76 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
MMS19Q96T76 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MMS19Q96T76 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MMS19Q96T76 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MMS19Q96T76 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MMS19Q96T76 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MMS19Q96T76 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MMS19Q96T76 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MMS19Q96T76 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MMS19Q96T76 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MMS19Q96T76 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MMS19Q96T76 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
MMS19Q96T76 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
MMS19Q96T76 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MMS19Q96T76 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MMS19Q96T76 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MMS19Q96T76 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MMS19Q96T76 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MMS19Q96T76 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms