Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK4

BBS4, Bardet-Biedl syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS4Q96RK4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BBS4Q96RK4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BBS4Q96RK4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BBS4Q96RK4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BBS4Q96RK4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BBS4Q96RK4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BBS4Q96RK4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BBS4Q96RK4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BBS4Q96RK4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BBS4Q96RK4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BBS4Q96RK4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BBS4Q96RK4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BBS4Q96RK4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BBS4Q96RK4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BBS4Q96RK4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BBS4Q96RK4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BBS4Q96RK4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BBS4Q96RK4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BBS4Q96RK4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BBS4Q96RK4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BBS4Q96RK4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BBS4Q96RK4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BBS4Q96RK4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BBS4Q96RK4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BBS4Q96RK4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BBS4Q96RK4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BBS4Q96RK4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BBS4Q96RK4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BBS4Q96RK4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BBS4Q96RK4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BBS4Q96RK4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
BBS4Q96RK4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BBS4Q96RK4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BBS4Q96RK4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BBS4Q96RK4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BBS4Q96RK4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BBS4Q96RK4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BBS4Q96RK4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BBS4Q96RK4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBS4Q96RK4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBS4Q96RK4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BBS4Q96RK4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BBS4Q96RK4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BBS4Q96RK4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BBS4Q96RK4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BBS4Q96RK4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BBS4Q96RK4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BBS4Q96RK4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BBS4Q96RK4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BBS4Q96RK4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BBS4Q96RK4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BBS4Q96RK4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BBS4Q96RK4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BBS4Q96RK4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BBS4Q96RK4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BBS4Q96RK4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BBS4Q96RK4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BBS4Q96RK4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BBS4Q96RK4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BBS4Q96RK4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BBS4Q96RK4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BBS4Q96RK4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BBS4Q96RK4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BBS4Q96RK4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BBS4Q96RK4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BBS4Q96RK4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BBS4Q96RK4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BBS4Q96RK4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BBS4Q96RK4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BBS4Q96RK4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BBS4Q96RK4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BBS4Q96RK4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BBS4Q96RK4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BBS4Q96RK4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BBS4Q96RK4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BBS4Q96RK4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BBS4Q96RK4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BBS4Q96RK4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BBS4Q96RK4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BBS4Q96RK4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BBS4Q96RK4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BBS4Q96RK4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BBS4Q96RK4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BBS4Q96RK4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BBS4Q96RK4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BBS4Q96RK4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BBS4Q96RK4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BBS4Q96RK4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BBS4Q96RK4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BBS4Q96RK4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BBS4Q96RK4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BBS4Q96RK4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BBS4Q96RK4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BBS4Q96RK4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BBS4Q96RK4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BBS4Q96RK4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BBS4Q96RK4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BBS4Q96RK4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BBS4Q96RK4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BBS4Q96RK4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms