Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP8

GBP5, Guanylate-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP5Q96PP8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GBP5Q96PP8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GBP5Q96PP8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GBP5Q96PP8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GBP5Q96PP8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GBP5Q96PP8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GBP5Q96PP8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GBP5Q96PP8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GBP5Q96PP8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GBP5Q96PP8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GBP5Q96PP8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBP5Q96PP8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBP5Q96PP8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBP5Q96PP8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GBP5Q96PP8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GBP5Q96PP8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GBP5Q96PP8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GBP5Q96PP8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GBP5Q96PP8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GBP5Q96PP8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GBP5Q96PP8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GBP5Q96PP8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GBP5Q96PP8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GBP5Q96PP8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GBP5Q96PP8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GBP5Q96PP8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GBP5Q96PP8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GBP5Q96PP8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GBP5Q96PP8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GBP5Q96PP8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GBP5Q96PP8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GBP5Q96PP8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GBP5Q96PP8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GBP5Q96PP8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GBP5Q96PP8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GBP5Q96PP8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GBP5Q96PP8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GBP5Q96PP8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GBP5Q96PP8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GBP5Q96PP8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GBP5Q96PP8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GBP5Q96PP8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GBP5Q96PP8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GBP5Q96PP8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GBP5Q96PP8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GBP5Q96PP8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GBP5Q96PP8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GBP5Q96PP8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GBP5Q96PP8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GBP5Q96PP8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GBP5Q96PP8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GBP5Q96PP8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GBP5Q96PP8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GBP5Q96PP8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GBP5Q96PP8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GBP5Q96PP8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GBP5Q96PP8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GBP5Q96PP8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GBP5Q96PP8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GBP5Q96PP8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GBP5Q96PP8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GBP5Q96PP8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GBP5Q96PP8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GBP5Q96PP8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GBP5Q96PP8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GBP5Q96PP8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms