Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF2

STAC3, SH3 and cysteine-rich domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAC3Q96MF2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
STAC3Q96MF2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
STAC3Q96MF2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
STAC3Q96MF2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
STAC3Q96MF2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
STAC3Q96MF2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
STAC3Q96MF2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
STAC3Q96MF2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
STAC3Q96MF2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
STAC3Q96MF2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC36.83■■■■□ 3.49
STAC3Q96MF2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
STAC3Q96MF2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
STAC3Q96MF2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
STAC3Q96MF2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.48
STAC3Q96MF2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
STAC3Q96MF2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
STAC3Q96MF2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
STAC3Q96MF2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
STAC3Q96MF2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
STAC3Q96MF2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
STAC3Q96MF2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
STAC3Q96MF2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
STAC3Q96MF2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
STAC3Q96MF2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
STAC3Q96MF2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
STAC3Q96MF2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
STAC3Q96MF2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC36.77■■■■□ 3.48
STAC3Q96MF2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
STAC3Q96MF2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.76■■■■□ 3.48
STAC3Q96MF2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.47
STAC3Q96MF2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
STAC3Q96MF2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
STAC3Q96MF2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
STAC3Q96MF2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
STAC3Q96MF2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
STAC3Q96MF2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
STAC3Q96MF2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
STAC3Q96MF2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
STAC3Q96MF2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
STAC3Q96MF2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
STAC3Q96MF2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
STAC3Q96MF2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
STAC3Q96MF2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
STAC3Q96MF2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
STAC3Q96MF2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
STAC3Q96MF2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
STAC3Q96MF2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
STAC3Q96MF2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
STAC3Q96MF2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
STAC3Q96MF2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
STAC3Q96MF2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
STAC3Q96MF2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
STAC3Q96MF2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
STAC3Q96MF2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
STAC3Q96MF2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
STAC3Q96MF2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
STAC3Q96MF2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
STAC3Q96MF2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
STAC3Q96MF2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
STAC3Q96MF2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
STAC3Q96MF2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
STAC3Q96MF2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
STAC3Q96MF2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
STAC3Q96MF2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
STAC3Q96MF2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
STAC3Q96MF2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
STAC3Q96MF2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
STAC3Q96MF2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
STAC3Q96MF2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
STAC3Q96MF2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
STAC3Q96MF2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
STAC3Q96MF2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
STAC3Q96MF2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
STAC3Q96MF2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
STAC3Q96MF2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
STAC3Q96MF2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
STAC3Q96MF2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
STAC3Q96MF2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
STAC3Q96MF2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
STAC3Q96MF2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
STAC3Q96MF2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
STAC3Q96MF2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
STAC3Q96MF2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
STAC3Q96MF2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
STAC3Q96MF2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
STAC3Q96MF2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
STAC3Q96MF2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
STAC3Q96MF2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
STAC3Q96MF2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
STAC3Q96MF2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
STAC3Q96MF2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
STAC3Q96MF2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
STAC3Q96MF2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
STAC3Q96MF2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
STAC3Q96MF2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
STAC3Q96MF2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
STAC3Q96MF2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
STAC3Q96MF2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
STAC3Q96MF2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
STAC3Q96MF2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms